Protein–RNA interactions for Protein: P55822

SH3BGR, SH3 domain-binding glutamic acid-rich protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BGRP55822 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SH3BGRP55822 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SH3BGRP55822 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SH3BGRP55822 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SH3BGRP55822 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SH3BGRP55822 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SH3BGRP55822 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SH3BGRP55822 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SH3BGRP55822 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SH3BGRP55822 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SH3BGRP55822 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SH3BGRP55822 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SH3BGRP55822 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SH3BGRP55822 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SH3BGRP55822 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SH3BGRP55822 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SH3BGRP55822 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SH3BGRP55822 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SH3BGRP55822 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SH3BGRP55822 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SH3BGRP55822 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SH3BGRP55822 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SH3BGRP55822 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SH3BGRP55822 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SH3BGRP55822 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SH3BGRP55822 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SH3BGRP55822 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SH3BGRP55822 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SH3BGRP55822 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SH3BGRP55822 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SH3BGRP55822 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SH3BGRP55822 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SH3BGRP55822 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SH3BGRP55822 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SH3BGRP55822 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SH3BGRP55822 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SH3BGRP55822 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SH3BGRP55822 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SH3BGRP55822 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SH3BGRP55822 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SH3BGRP55822 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SH3BGRP55822 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SH3BGRP55822 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SH3BGRP55822 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SH3BGRP55822 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SH3BGRP55822 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SH3BGRP55822 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SH3BGRP55822 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SH3BGRP55822 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SH3BGRP55822 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SH3BGRP55822 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SH3BGRP55822 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SH3BGRP55822 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SH3BGRP55822 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SH3BGRP55822 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SH3BGRP55822 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SH3BGRP55822 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SH3BGRP55822 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SH3BGRP55822 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SH3BGRP55822 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SH3BGRP55822 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SH3BGRP55822 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SH3BGRP55822 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SH3BGRP55822 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SH3BGRP55822 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SH3BGRP55822 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SH3BGRP55822 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SH3BGRP55822 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SH3BGRP55822 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SH3BGRP55822 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SH3BGRP55822 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SH3BGRP55822 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SH3BGRP55822 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SH3BGRP55822 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SH3BGRP55822 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SH3BGRP55822 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SH3BGRP55822 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SH3BGRP55822 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SH3BGRP55822 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SH3BGRP55822 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SH3BGRP55822 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SH3BGRP55822 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SH3BGRP55822 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SH3BGRP55822 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SH3BGRP55822 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SH3BGRP55822 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SH3BGRP55822 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SH3BGRP55822 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SH3BGRP55822 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SH3BGRP55822 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SH3BGRP55822 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SH3BGRP55822 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SH3BGRP55822 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SH3BGRP55822 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SH3BGRP55822 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SH3BGRP55822 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SH3BGRP55822 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SH3BGRP55822 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SH3BGRP55822 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SH3BGRP55822 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms