Protein–RNA interactions for Protein: P55107

GDF10, Growth/differentiation factor 10, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF10P55107 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GDF10P55107 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GDF10P55107 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GDF10P55107 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GDF10P55107 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GDF10P55107 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GDF10P55107 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GDF10P55107 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GDF10P55107 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GDF10P55107 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GDF10P55107 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GDF10P55107 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
GDF10P55107 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GDF10P55107 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GDF10P55107 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GDF10P55107 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GDF10P55107 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GDF10P55107 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GDF10P55107 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GDF10P55107 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GDF10P55107 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GDF10P55107 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GDF10P55107 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GDF10P55107 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GDF10P55107 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GDF10P55107 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GDF10P55107 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
GDF10P55107 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
GDF10P55107 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GDF10P55107 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GDF10P55107 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GDF10P55107 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GDF10P55107 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GDF10P55107 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GDF10P55107 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GDF10P55107 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
GDF10P55107 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GDF10P55107 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GDF10P55107 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GDF10P55107 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GDF10P55107 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GDF10P55107 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GDF10P55107 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GDF10P55107 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GDF10P55107 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GDF10P55107 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GDF10P55107 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GDF10P55107 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GDF10P55107 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GDF10P55107 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GDF10P55107 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GDF10P55107 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GDF10P55107 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GDF10P55107 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GDF10P55107 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GDF10P55107 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GDF10P55107 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GDF10P55107 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
GDF10P55107 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GDF10P55107 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GDF10P55107 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GDF10P55107 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GDF10P55107 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
GDF10P55107 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GDF10P55107 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GDF10P55107 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GDF10P55107 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GDF10P55107 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GDF10P55107 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GDF10P55107 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
GDF10P55107 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GDF10P55107 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GDF10P55107 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GDF10P55107 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GDF10P55107 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GDF10P55107 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GDF10P55107 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GDF10P55107 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GDF10P55107 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GDF10P55107 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GDF10P55107 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GDF10P55107 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GDF10P55107 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GDF10P55107 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GDF10P55107 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GDF10P55107 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GDF10P55107 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GDF10P55107 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GDF10P55107 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GDF10P55107 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GDF10P55107 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GDF10P55107 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
GDF10P55107 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
GDF10P55107 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
GDF10P55107 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
GDF10P55107 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
GDF10P55107 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GDF10P55107 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GDF10P55107 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GDF10P55107 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms