Protein–RNA interactions for Protein: P55084

HADHB, Trifunctional enzyme subunit beta, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HADHBP55084 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HADHBP55084 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HADHBP55084 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HADHBP55084 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HADHBP55084 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HADHBP55084 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HADHBP55084 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HADHBP55084 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HADHBP55084 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HADHBP55084 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HADHBP55084 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HADHBP55084 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HADHBP55084 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HADHBP55084 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HADHBP55084 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HADHBP55084 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HADHBP55084 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HADHBP55084 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HADHBP55084 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HADHBP55084 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HADHBP55084 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HADHBP55084 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HADHBP55084 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HADHBP55084 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HADHBP55084 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HADHBP55084 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HADHBP55084 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HADHBP55084 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
HADHBP55084 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
HADHBP55084 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HADHBP55084 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HADHBP55084 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HADHBP55084 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HADHBP55084 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HADHBP55084 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HADHBP55084 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HADHBP55084 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HADHBP55084 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HADHBP55084 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HADHBP55084 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HADHBP55084 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HADHBP55084 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HADHBP55084 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HADHBP55084 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HADHBP55084 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HADHBP55084 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HADHBP55084 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HADHBP55084 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HADHBP55084 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HADHBP55084 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HADHBP55084 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HADHBP55084 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HADHBP55084 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HADHBP55084 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HADHBP55084 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HADHBP55084 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HADHBP55084 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HADHBP55084 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HADHBP55084 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HADHBP55084 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HADHBP55084 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HADHBP55084 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HADHBP55084 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HADHBP55084 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HADHBP55084 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HADHBP55084 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HADHBP55084 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HADHBP55084 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HADHBP55084 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HADHBP55084 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HADHBP55084 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HADHBP55084 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HADHBP55084 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HADHBP55084 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HADHBP55084 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HADHBP55084 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HADHBP55084 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HADHBP55084 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HADHBP55084 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HADHBP55084 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HADHBP55084 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HADHBP55084 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HADHBP55084 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HADHBP55084 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HADHBP55084 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HADHBP55084 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HADHBP55084 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HADHBP55084 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HADHBP55084 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HADHBP55084 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HADHBP55084 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HADHBP55084 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HADHBP55084 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HADHBP55084 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HADHBP55084 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HADHBP55084 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HADHBP55084 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HADHBP55084 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HADHBP55084 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HADHBP55084 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms