Protein–RNA interactions for Protein: P53365

ARFIP2, Arfaptin-2, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFIP2P53365 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ARFIP2P53365 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
ARFIP2P53365 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ARFIP2P53365 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ARFIP2P53365 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ARFIP2P53365 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ARFIP2P53365 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ARFIP2P53365 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ARFIP2P53365 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ARFIP2P53365 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ARFIP2P53365 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ARFIP2P53365 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ARFIP2P53365 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ARFIP2P53365 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ARFIP2P53365 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ARFIP2P53365 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ARFIP2P53365 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ARFIP2P53365 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ARFIP2P53365 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ARFIP2P53365 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ARFIP2P53365 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ARFIP2P53365 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ARFIP2P53365 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ARFIP2P53365 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ARFIP2P53365 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ARFIP2P53365 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ARFIP2P53365 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ARFIP2P53365 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ARFIP2P53365 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ARFIP2P53365 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ARFIP2P53365 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ARFIP2P53365 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ARFIP2P53365 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ARFIP2P53365 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ARFIP2P53365 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ARFIP2P53365 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ARFIP2P53365 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ARFIP2P53365 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ARFIP2P53365 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ARFIP2P53365 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ARFIP2P53365 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
ARFIP2P53365 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ARFIP2P53365 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ARFIP2P53365 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ARFIP2P53365 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ARFIP2P53365 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ARFIP2P53365 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ARFIP2P53365 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
ARFIP2P53365 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
ARFIP2P53365 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ARFIP2P53365 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ARFIP2P53365 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ARFIP2P53365 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ARFIP2P53365 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ARFIP2P53365 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ARFIP2P53365 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ARFIP2P53365 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ARFIP2P53365 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ARFIP2P53365 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ARFIP2P53365 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ARFIP2P53365 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ARFIP2P53365 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ARFIP2P53365 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ARFIP2P53365 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ARFIP2P53365 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ARFIP2P53365 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ARFIP2P53365 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ARFIP2P53365 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ARFIP2P53365 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ARFIP2P53365 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ARFIP2P53365 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ARFIP2P53365 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ARFIP2P53365 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ARFIP2P53365 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ARFIP2P53365 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ARFIP2P53365 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ARFIP2P53365 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ARFIP2P53365 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ARFIP2P53365 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ARFIP2P53365 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ARFIP2P53365 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ARFIP2P53365 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ARFIP2P53365 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
ARFIP2P53365 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ARFIP2P53365 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ARFIP2P53365 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ARFIP2P53365 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ARFIP2P53365 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ARFIP2P53365 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ARFIP2P53365 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ARFIP2P53365 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ARFIP2P53365 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ARFIP2P53365 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
ARFIP2P53365 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ARFIP2P53365 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ARFIP2P53365 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ARFIP2P53365 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ARFIP2P53365 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ARFIP2P53365 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ARFIP2P53365 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms