Protein–RNA interactions for Protein: P52952

NKX2-5, Homeobox protein Nkx-2.5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX2-5P52952 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NKX2-5P52952 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NKX2-5P52952 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NKX2-5P52952 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NKX2-5P52952 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
NKX2-5P52952 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NKX2-5P52952 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NKX2-5P52952 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NKX2-5P52952 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NKX2-5P52952 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NKX2-5P52952 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
NKX2-5P52952 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
NKX2-5P52952 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NKX2-5P52952 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NKX2-5P52952 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NKX2-5P52952 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NKX2-5P52952 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NKX2-5P52952 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NKX2-5P52952 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NKX2-5P52952 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NKX2-5P52952 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NKX2-5P52952 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NKX2-5P52952 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NKX2-5P52952 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NKX2-5P52952 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NKX2-5P52952 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NKX2-5P52952 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NKX2-5P52952 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NKX2-5P52952 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NKX2-5P52952 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NKX2-5P52952 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
NKX2-5P52952 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NKX2-5P52952 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NKX2-5P52952 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NKX2-5P52952 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NKX2-5P52952 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NKX2-5P52952 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NKX2-5P52952 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NKX2-5P52952 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NKX2-5P52952 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
NKX2-5P52952 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NKX2-5P52952 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NKX2-5P52952 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NKX2-5P52952 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NKX2-5P52952 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NKX2-5P52952 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NKX2-5P52952 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NKX2-5P52952 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NKX2-5P52952 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NKX2-5P52952 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NKX2-5P52952 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NKX2-5P52952 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NKX2-5P52952 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NKX2-5P52952 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NKX2-5P52952 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NKX2-5P52952 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NKX2-5P52952 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NKX2-5P52952 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NKX2-5P52952 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NKX2-5P52952 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NKX2-5P52952 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NKX2-5P52952 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
NKX2-5P52952 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NKX2-5P52952 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NKX2-5P52952 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NKX2-5P52952 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NKX2-5P52952 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NKX2-5P52952 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NKX2-5P52952 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NKX2-5P52952 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NKX2-5P52952 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NKX2-5P52952 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NKX2-5P52952 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NKX2-5P52952 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
NKX2-5P52952 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NKX2-5P52952 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NKX2-5P52952 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NKX2-5P52952 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NKX2-5P52952 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NKX2-5P52952 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NKX2-5P52952 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NKX2-5P52952 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NKX2-5P52952 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NKX2-5P52952 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NKX2-5P52952 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NKX2-5P52952 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NKX2-5P52952 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NKX2-5P52952 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NKX2-5P52952 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NKX2-5P52952 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NKX2-5P52952 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NKX2-5P52952 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NKX2-5P52952 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NKX2-5P52952 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NKX2-5P52952 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NKX2-5P52952 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NKX2-5P52952 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NKX2-5P52952 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NKX2-5P52952 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NKX2-5P52952 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms