Protein–RNA interactions for Protein: P49759

CLK1, Dual specificity protein kinase CLK1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLK1P49759 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CLK1P49759 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CLK1P49759 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CLK1P49759 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CLK1P49759 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CLK1P49759 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CLK1P49759 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CLK1P49759 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CLK1P49759 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CLK1P49759 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CLK1P49759 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CLK1P49759 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CLK1P49759 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CLK1P49759 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CLK1P49759 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CLK1P49759 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CLK1P49759 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CLK1P49759 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CLK1P49759 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
CLK1P49759 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CLK1P49759 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CLK1P49759 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CLK1P49759 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CLK1P49759 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CLK1P49759 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CLK1P49759 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
CLK1P49759 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CLK1P49759 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CLK1P49759 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CLK1P49759 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CLK1P49759 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CLK1P49759 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CLK1P49759 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CLK1P49759 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CLK1P49759 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CLK1P49759 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CLK1P49759 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CLK1P49759 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CLK1P49759 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
CLK1P49759 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CLK1P49759 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
CLK1P49759 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CLK1P49759 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CLK1P49759 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CLK1P49759 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CLK1P49759 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CLK1P49759 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CLK1P49759 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CLK1P49759 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CLK1P49759 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CLK1P49759 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CLK1P49759 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CLK1P49759 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CLK1P49759 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CLK1P49759 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CLK1P49759 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CLK1P49759 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CLK1P49759 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
CLK1P49759 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CLK1P49759 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CLK1P49759 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CLK1P49759 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CLK1P49759 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CLK1P49759 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CLK1P49759 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CLK1P49759 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CLK1P49759 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CLK1P49759 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CLK1P49759 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CLK1P49759 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
CLK1P49759 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CLK1P49759 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CLK1P49759 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CLK1P49759 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CLK1P49759 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CLK1P49759 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CLK1P49759 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
CLK1P49759 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CLK1P49759 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CLK1P49759 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CLK1P49759 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CLK1P49759 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CLK1P49759 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CLK1P49759 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CLK1P49759 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CLK1P49759 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CLK1P49759 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CLK1P49759 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CLK1P49759 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CLK1P49759 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CLK1P49759 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CLK1P49759 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CLK1P49759 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CLK1P49759 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CLK1P49759 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CLK1P49759 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CLK1P49759 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CLK1P49759 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CLK1P49759 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CLK1P49759 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms