Protein–RNA interactions for Protein: P47895

ALDH1A3, Aldehyde dehydrogenase family 1 member A3, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALDH1A3P47895 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ALDH1A3P47895 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ALDH1A3P47895 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ALDH1A3P47895 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ALDH1A3P47895 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ALDH1A3P47895 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ALDH1A3P47895 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ALDH1A3P47895 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ALDH1A3P47895 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ALDH1A3P47895 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ALDH1A3P47895 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ALDH1A3P47895 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ALDH1A3P47895 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ALDH1A3P47895 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ALDH1A3P47895 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ALDH1A3P47895 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ALDH1A3P47895 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ALDH1A3P47895 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ALDH1A3P47895 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ALDH1A3P47895 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ALDH1A3P47895 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ALDH1A3P47895 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ALDH1A3P47895 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ALDH1A3P47895 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
ALDH1A3P47895 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ALDH1A3P47895 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ALDH1A3P47895 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ALDH1A3P47895 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ALDH1A3P47895 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ALDH1A3P47895 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ALDH1A3P47895 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ALDH1A3P47895 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ALDH1A3P47895 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ALDH1A3P47895 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ALDH1A3P47895 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ALDH1A3P47895 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ALDH1A3P47895 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ALDH1A3P47895 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ALDH1A3P47895 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ALDH1A3P47895 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
ALDH1A3P47895 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ALDH1A3P47895 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ALDH1A3P47895 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ALDH1A3P47895 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
ALDH1A3P47895 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ALDH1A3P47895 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ALDH1A3P47895 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ALDH1A3P47895 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ALDH1A3P47895 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ALDH1A3P47895 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ALDH1A3P47895 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ALDH1A3P47895 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ALDH1A3P47895 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ALDH1A3P47895 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ALDH1A3P47895 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ALDH1A3P47895 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ALDH1A3P47895 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ALDH1A3P47895 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
ALDH1A3P47895 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ALDH1A3P47895 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ALDH1A3P47895 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ALDH1A3P47895 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ALDH1A3P47895 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
ALDH1A3P47895 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ALDH1A3P47895 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ALDH1A3P47895 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ALDH1A3P47895 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ALDH1A3P47895 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ALDH1A3P47895 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ALDH1A3P47895 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ALDH1A3P47895 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ALDH1A3P47895 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ALDH1A3P47895 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ALDH1A3P47895 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ALDH1A3P47895 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ALDH1A3P47895 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
ALDH1A3P47895 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ALDH1A3P47895 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ALDH1A3P47895 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
ALDH1A3P47895 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ALDH1A3P47895 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ALDH1A3P47895 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ALDH1A3P47895 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ALDH1A3P47895 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ALDH1A3P47895 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ALDH1A3P47895 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ALDH1A3P47895 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ALDH1A3P47895 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ALDH1A3P47895 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ALDH1A3P47895 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ALDH1A3P47895 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ALDH1A3P47895 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ALDH1A3P47895 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ALDH1A3P47895 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ALDH1A3P47895 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ALDH1A3P47895 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ALDH1A3P47895 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ALDH1A3P47895 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ALDH1A3P47895 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ALDH1A3P47895 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms