Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ACADSBP45954 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ACADSBP45954 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ACADSBP45954 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ACADSBP45954 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ACADSBP45954 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ACADSBP45954 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ACADSBP45954 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ACADSBP45954 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ACADSBP45954 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ACADSBP45954 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ACADSBP45954 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ACADSBP45954 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ACADSBP45954 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ACADSBP45954 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ACADSBP45954 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ACADSBP45954 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ACADSBP45954 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ACADSBP45954 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ACADSBP45954 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ACADSBP45954 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ACADSBP45954 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ACADSBP45954 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ACADSBP45954 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ACADSBP45954 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ACADSBP45954 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ACADSBP45954 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ACADSBP45954 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ACADSBP45954 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ACADSBP45954 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ACADSBP45954 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ACADSBP45954 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ACADSBP45954 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ACADSBP45954 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ACADSBP45954 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACADSBP45954 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACADSBP45954 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACADSBP45954 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACADSBP45954 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACADSBP45954 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACADSBP45954 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACADSBP45954 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACADSBP45954 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACADSBP45954 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACADSBP45954 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACADSBP45954 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACADSBP45954 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACADSBP45954 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACADSBP45954 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACADSBP45954 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACADSBP45954 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ACADSBP45954 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ACADSBP45954 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACADSBP45954 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACADSBP45954 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACADSBP45954 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACADSBP45954 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACADSBP45954 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACADSBP45954 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACADSBP45954 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACADSBP45954 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACADSBP45954 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACADSBP45954 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ACADSBP45954 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ACADSBP45954 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACADSBP45954 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACADSBP45954 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACADSBP45954 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACADSBP45954 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACADSBP45954 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACADSBP45954 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACADSBP45954 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACADSBP45954 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACADSBP45954 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACADSBP45954 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ACADSBP45954 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ACADSBP45954 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ACADSBP45954 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ACADSBP45954 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ACADSBP45954 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ACADSBP45954 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ACADSBP45954 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ACADSBP45954 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACADSBP45954 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACADSBP45954 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACADSBP45954 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACADSBP45954 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACADSBP45954 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACADSBP45954 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACADSBP45954 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACADSBP45954 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACADSBP45954 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACADSBP45954 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ACADSBP45954 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACADSBP45954 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACADSBP45954 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACADSBP45954 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACADSBP45954 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACADSBP45954 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACADSBP45954 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms