Protein–RNA interactions for Protein: P45378

TNNT3, Troponin T, fast skeletal muscle, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNT3P45378 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TNNT3P45378 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TNNT3P45378 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TNNT3P45378 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TNNT3P45378 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TNNT3P45378 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TNNT3P45378 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TNNT3P45378 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TNNT3P45378 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TNNT3P45378 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNNT3P45378 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNNT3P45378 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNNT3P45378 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNNT3P45378 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNNT3P45378 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNNT3P45378 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNNT3P45378 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TNNT3P45378 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNNT3P45378 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNNT3P45378 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNNT3P45378 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNNT3P45378 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNNT3P45378 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNNT3P45378 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNNT3P45378 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNNT3P45378 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNNT3P45378 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TNNT3P45378 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TNNT3P45378 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TNNT3P45378 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TNNT3P45378 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TNNT3P45378 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TNNT3P45378 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TNNT3P45378 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TNNT3P45378 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TNNT3P45378 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TNNT3P45378 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNNT3P45378 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNNT3P45378 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNNT3P45378 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNNT3P45378 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNNT3P45378 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNNT3P45378 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNNT3P45378 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNNT3P45378 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNNT3P45378 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNNT3P45378 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNNT3P45378 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNNT3P45378 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNNT3P45378 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNNT3P45378 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNNT3P45378 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNNT3P45378 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNNT3P45378 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNNT3P45378 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNNT3P45378 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNNT3P45378 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNNT3P45378 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNNT3P45378 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNNT3P45378 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNNT3P45378 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNNT3P45378 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNNT3P45378 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNNT3P45378 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNNT3P45378 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TNNT3P45378 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TNNT3P45378 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNNT3P45378 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNNT3P45378 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNNT3P45378 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNNT3P45378 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TNNT3P45378 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TNNT3P45378 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TNNT3P45378 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TNNT3P45378 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TNNT3P45378 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNNT3P45378 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNNT3P45378 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNNT3P45378 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNNT3P45378 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNNT3P45378 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNNT3P45378 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNNT3P45378 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNNT3P45378 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNNT3P45378 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNNT3P45378 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNNT3P45378 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNNT3P45378 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNNT3P45378 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNNT3P45378 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNNT3P45378 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNNT3P45378 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNNT3P45378 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TNNT3P45378 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNNT3P45378 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNNT3P45378 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNNT3P45378 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNNT3P45378 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TNNT3P45378 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNNT3P45378 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms