Protein–RNA interactions for Protein: P41219

PRPH, Peripherin, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPHP41219 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRPHP41219 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
PRPHP41219 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRPHP41219 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
PRPHP41219 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PRPHP41219 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PRPHP41219 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PRPHP41219 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PRPHP41219 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRPHP41219 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRPHP41219 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRPHP41219 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
PRPHP41219 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRPHP41219 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRPHP41219 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRPHP41219 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRPHP41219 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRPHP41219 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRPHP41219 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRPHP41219 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRPHP41219 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRPHP41219 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRPHP41219 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRPHP41219 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRPHP41219 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRPHP41219 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRPHP41219 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRPHP41219 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRPHP41219 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PRPHP41219 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRPHP41219 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRPHP41219 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRPHP41219 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRPHP41219 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRPHP41219 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRPHP41219 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRPHP41219 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRPHP41219 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRPHP41219 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRPHP41219 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRPHP41219 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRPHP41219 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRPHP41219 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRPHP41219 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRPHP41219 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRPHP41219 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRPHP41219 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRPHP41219 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRPHP41219 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRPHP41219 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRPHP41219 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRPHP41219 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRPHP41219 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRPHP41219 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRPHP41219 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRPHP41219 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRPHP41219 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRPHP41219 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRPHP41219 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRPHP41219 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRPHP41219 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRPHP41219 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRPHP41219 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRPHP41219 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRPHP41219 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRPHP41219 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRPHP41219 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRPHP41219 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRPHP41219 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRPHP41219 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRPHP41219 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRPHP41219 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRPHP41219 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRPHP41219 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRPHP41219 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRPHP41219 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRPHP41219 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRPHP41219 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRPHP41219 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRPHP41219 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
PRPHP41219 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
PRPHP41219 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PRPHP41219 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRPHP41219 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRPHP41219 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRPHP41219 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRPHP41219 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRPHP41219 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRPHP41219 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRPHP41219 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRPHP41219 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRPHP41219 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRPHP41219 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRPHP41219 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRPHP41219 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRPHP41219 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRPHP41219 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRPHP41219 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRPHP41219 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRPHP41219 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms