Protein–RNA interactions for Protein: P40225

THPO, Thrombopoietin, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THPOP40225 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
THPOP40225 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
THPOP40225 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
THPOP40225 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
THPOP40225 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
THPOP40225 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
THPOP40225 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
THPOP40225 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
THPOP40225 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
THPOP40225 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
THPOP40225 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
THPOP40225 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
THPOP40225 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
THPOP40225 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
THPOP40225 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
THPOP40225 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
THPOP40225 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
THPOP40225 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
THPOP40225 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
THPOP40225 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
THPOP40225 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
THPOP40225 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
THPOP40225 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
THPOP40225 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
THPOP40225 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
THPOP40225 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
THPOP40225 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
THPOP40225 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
THPOP40225 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
THPOP40225 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
THPOP40225 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
THPOP40225 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
THPOP40225 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
THPOP40225 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
THPOP40225 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
THPOP40225 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
THPOP40225 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
THPOP40225 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
THPOP40225 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
THPOP40225 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
THPOP40225 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
THPOP40225 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
THPOP40225 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
THPOP40225 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
THPOP40225 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
THPOP40225 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
THPOP40225 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
THPOP40225 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
THPOP40225 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
THPOP40225 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
THPOP40225 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
THPOP40225 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
THPOP40225 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
THPOP40225 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
THPOP40225 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
THPOP40225 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
THPOP40225 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
THPOP40225 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
THPOP40225 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
THPOP40225 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
THPOP40225 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
THPOP40225 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
THPOP40225 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
THPOP40225 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
THPOP40225 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
THPOP40225 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
THPOP40225 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
THPOP40225 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
THPOP40225 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
THPOP40225 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
THPOP40225 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
THPOP40225 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
THPOP40225 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
THPOP40225 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
THPOP40225 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
THPOP40225 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
THPOP40225 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
THPOP40225 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
THPOP40225 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
THPOP40225 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
THPOP40225 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
THPOP40225 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
THPOP40225 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
THPOP40225 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
THPOP40225 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
THPOP40225 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
THPOP40225 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
THPOP40225 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
THPOP40225 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
THPOP40225 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
THPOP40225 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
THPOP40225 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
THPOP40225 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
THPOP40225 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
THPOP40225 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
THPOP40225 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
THPOP40225 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
THPOP40225 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
THPOP40225 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
THPOP40225 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59 ms