Protein–RNA interactions for Protein: P38919

EIF4A3, Eukaryotic initiation factor 4A-III, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF4A3P38919 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
EIF4A3P38919 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EIF4A3P38919 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
EIF4A3P38919 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EIF4A3P38919 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
EIF4A3P38919 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EIF4A3P38919 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EIF4A3P38919 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EIF4A3P38919 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
EIF4A3P38919 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
EIF4A3P38919 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EIF4A3P38919 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
EIF4A3P38919 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EIF4A3P38919 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EIF4A3P38919 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
EIF4A3P38919 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
EIF4A3P38919 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
EIF4A3P38919 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
EIF4A3P38919 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EIF4A3P38919 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
EIF4A3P38919 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EIF4A3P38919 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EIF4A3P38919 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EIF4A3P38919 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
EIF4A3P38919 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
EIF4A3P38919 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
EIF4A3P38919 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EIF4A3P38919 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EIF4A3P38919 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
EIF4A3P38919 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
EIF4A3P38919 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
EIF4A3P38919 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EIF4A3P38919 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
EIF4A3P38919 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EIF4A3P38919 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
EIF4A3P38919 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EIF4A3P38919 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
EIF4A3P38919 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
EIF4A3P38919 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EIF4A3P38919 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EIF4A3P38919 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EIF4A3P38919 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EIF4A3P38919 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
EIF4A3P38919 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EIF4A3P38919 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EIF4A3P38919 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EIF4A3P38919 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
EIF4A3P38919 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EIF4A3P38919 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
EIF4A3P38919 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
EIF4A3P38919 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
EIF4A3P38919 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
EIF4A3P38919 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EIF4A3P38919 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EIF4A3P38919 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
EIF4A3P38919 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
EIF4A3P38919 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EIF4A3P38919 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
EIF4A3P38919 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
EIF4A3P38919 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EIF4A3P38919 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
EIF4A3P38919 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EIF4A3P38919 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EIF4A3P38919 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
EIF4A3P38919 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EIF4A3P38919 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
EIF4A3P38919 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EIF4A3P38919 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EIF4A3P38919 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EIF4A3P38919 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EIF4A3P38919 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
EIF4A3P38919 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
EIF4A3P38919 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
EIF4A3P38919 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EIF4A3P38919 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EIF4A3P38919 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
EIF4A3P38919 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
EIF4A3P38919 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
EIF4A3P38919 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
EIF4A3P38919 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
EIF4A3P38919 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
EIF4A3P38919 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
EIF4A3P38919 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
EIF4A3P38919 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
EIF4A3P38919 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
EIF4A3P38919 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
EIF4A3P38919 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
EIF4A3P38919 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
EIF4A3P38919 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EIF4A3P38919 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EIF4A3P38919 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EIF4A3P38919 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EIF4A3P38919 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
EIF4A3P38919 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EIF4A3P38919 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EIF4A3P38919 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EIF4A3P38919 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EIF4A3P38919 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EIF4A3P38919 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EIF4A3P38919 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms