Protein–RNA interactions for Protein: P35658

NUP214, Nuclear pore complex protein Nup214, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,090 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP214P35658 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NUP214P35658 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NUP214P35658 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NUP214P35658 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NUP214P35658 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NUP214P35658 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NUP214P35658 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NUP214P35658 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NUP214P35658 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NUP214P35658 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NUP214P35658 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NUP214P35658 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NUP214P35658 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NUP214P35658 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NUP214P35658 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NUP214P35658 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NUP214P35658 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NUP214P35658 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NUP214P35658 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
NUP214P35658 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
NUP214P35658 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
NUP214P35658 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NUP214P35658 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NUP214P35658 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NUP214P35658 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NUP214P35658 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NUP214P35658 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NUP214P35658 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NUP214P35658 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NUP214P35658 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NUP214P35658 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NUP214P35658 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NUP214P35658 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NUP214P35658 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
NUP214P35658 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NUP214P35658 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
NUP214P35658 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NUP214P35658 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NUP214P35658 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NUP214P35658 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NUP214P35658 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NUP214P35658 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NUP214P35658 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NUP214P35658 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NUP214P35658 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
NUP214P35658 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NUP214P35658 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NUP214P35658 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NUP214P35658 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NUP214P35658 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NUP214P35658 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NUP214P35658 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NUP214P35658 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NUP214P35658 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NUP214P35658 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NUP214P35658 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NUP214P35658 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NUP214P35658 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NUP214P35658 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NUP214P35658 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NUP214P35658 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NUP214P35658 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
NUP214P35658 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NUP214P35658 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
NUP214P35658 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NUP214P35658 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NUP214P35658 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NUP214P35658 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NUP214P35658 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NUP214P35658 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NUP214P35658 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NUP214P35658 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NUP214P35658 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NUP214P35658 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NUP214P35658 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NUP214P35658 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NUP214P35658 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NUP214P35658 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NUP214P35658 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NUP214P35658 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NUP214P35658 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NUP214P35658 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NUP214P35658 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NUP214P35658 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NUP214P35658 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NUP214P35658 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NUP214P35658 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NUP214P35658 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NUP214P35658 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NUP214P35658 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NUP214P35658 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NUP214P35658 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NUP214P35658 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NUP214P35658 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NUP214P35658 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NUP214P35658 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NUP214P35658 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NUP214P35658 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NUP214P35658 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NUP214P35658 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms