Protein–RNA interactions for Protein: P35453

HOXD13, Homeobox protein Hox-D13, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13P35453 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HOXD13P35453 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HOXD13P35453 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HOXD13P35453 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HOXD13P35453 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HOXD13P35453 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HOXD13P35453 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HOXD13P35453 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HOXD13P35453 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HOXD13P35453 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HOXD13P35453 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HOXD13P35453 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HOXD13P35453 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HOXD13P35453 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HOXD13P35453 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HOXD13P35453 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HOXD13P35453 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HOXD13P35453 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HOXD13P35453 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HOXD13P35453 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HOXD13P35453 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HOXD13P35453 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HOXD13P35453 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HOXD13P35453 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HOXD13P35453 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HOXD13P35453 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HOXD13P35453 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HOXD13P35453 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
HOXD13P35453 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HOXD13P35453 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HOXD13P35453 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HOXD13P35453 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HOXD13P35453 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HOXD13P35453 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HOXD13P35453 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HOXD13P35453 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HOXD13P35453 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HOXD13P35453 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HOXD13P35453 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HOXD13P35453 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HOXD13P35453 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HOXD13P35453 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HOXD13P35453 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HOXD13P35453 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HOXD13P35453 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HOXD13P35453 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HOXD13P35453 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HOXD13P35453 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HOXD13P35453 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HOXD13P35453 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
HOXD13P35453 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HOXD13P35453 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HOXD13P35453 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HOXD13P35453 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HOXD13P35453 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HOXD13P35453 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HOXD13P35453 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HOXD13P35453 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HOXD13P35453 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HOXD13P35453 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HOXD13P35453 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HOXD13P35453 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HOXD13P35453 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HOXD13P35453 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HOXD13P35453 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HOXD13P35453 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
HOXD13P35453 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
HOXD13P35453 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
HOXD13P35453 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HOXD13P35453 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HOXD13P35453 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HOXD13P35453 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HOXD13P35453 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HOXD13P35453 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HOXD13P35453 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HOXD13P35453 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HOXD13P35453 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HOXD13P35453 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HOXD13P35453 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HOXD13P35453 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HOXD13P35453 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HOXD13P35453 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HOXD13P35453 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HOXD13P35453 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HOXD13P35453 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HOXD13P35453 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HOXD13P35453 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HOXD13P35453 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HOXD13P35453 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HOXD13P35453 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HOXD13P35453 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HOXD13P35453 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HOXD13P35453 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HOXD13P35453 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HOXD13P35453 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HOXD13P35453 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HOXD13P35453 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HOXD13P35453 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HOXD13P35453 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HOXD13P35453 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms