Protein–RNA interactions for Protein: P31269

HOXA9, Homeobox protein Hox-A9, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA9P31269 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXA9P31269 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXA9P31269 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXA9P31269 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXA9P31269 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXA9P31269 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXA9P31269 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXA9P31269 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXA9P31269 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXA9P31269 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXA9P31269 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXA9P31269 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXA9P31269 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXA9P31269 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXA9P31269 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXA9P31269 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXA9P31269 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXA9P31269 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXA9P31269 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXA9P31269 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXA9P31269 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXA9P31269 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXA9P31269 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXA9P31269 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXA9P31269 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXA9P31269 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXA9P31269 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXA9P31269 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXA9P31269 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXA9P31269 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXA9P31269 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXA9P31269 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HOXA9P31269 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HOXA9P31269 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HOXA9P31269 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HOXA9P31269 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
HOXA9P31269 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HOXA9P31269 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HOXA9P31269 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HOXA9P31269 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HOXA9P31269 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HOXA9P31269 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HOXA9P31269 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HOXA9P31269 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HOXA9P31269 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
HOXA9P31269 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
HOXA9P31269 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HOXA9P31269 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HOXA9P31269 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXA9P31269 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXA9P31269 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXA9P31269 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXA9P31269 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXA9P31269 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXA9P31269 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXA9P31269 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXA9P31269 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXA9P31269 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXA9P31269 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXA9P31269 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXA9P31269 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXA9P31269 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXA9P31269 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXA9P31269 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXA9P31269 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXA9P31269 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXA9P31269 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXA9P31269 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXA9P31269 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXA9P31269 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXA9P31269 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXA9P31269 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXA9P31269 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXA9P31269 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXA9P31269 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXA9P31269 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXA9P31269 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXA9P31269 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXA9P31269 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXA9P31269 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXA9P31269 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXA9P31269 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXA9P31269 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXA9P31269 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXA9P31269 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXA9P31269 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXA9P31269 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXA9P31269 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXA9P31269 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXA9P31269 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXA9P31269 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXA9P31269 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXA9P31269 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXA9P31269 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXA9P31269 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXA9P31269 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXA9P31269 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXA9P31269 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXA9P31269 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXA9P31269 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms