Protein–RNA interactions for Protein: P29965

CD40LG, CD40 ligand, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD40LGP29965 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CD40LGP29965 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CD40LGP29965 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CD40LGP29965 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CD40LGP29965 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CD40LGP29965 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CD40LGP29965 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CD40LGP29965 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CD40LGP29965 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CD40LGP29965 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CD40LGP29965 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CD40LGP29965 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CD40LGP29965 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CD40LGP29965 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CD40LGP29965 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
CD40LGP29965 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CD40LGP29965 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
CD40LGP29965 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CD40LGP29965 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CD40LGP29965 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CD40LGP29965 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CD40LGP29965 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CD40LGP29965 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CD40LGP29965 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CD40LGP29965 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CD40LGP29965 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CD40LGP29965 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CD40LGP29965 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CD40LGP29965 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CD40LGP29965 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CD40LGP29965 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CD40LGP29965 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CD40LGP29965 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CD40LGP29965 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CD40LGP29965 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CD40LGP29965 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CD40LGP29965 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CD40LGP29965 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CD40LGP29965 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CD40LGP29965 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CD40LGP29965 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CD40LGP29965 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CD40LGP29965 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CD40LGP29965 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CD40LGP29965 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CD40LGP29965 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CD40LGP29965 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CD40LGP29965 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CD40LGP29965 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CD40LGP29965 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CD40LGP29965 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CD40LGP29965 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CD40LGP29965 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
CD40LGP29965 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CD40LGP29965 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CD40LGP29965 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CD40LGP29965 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CD40LGP29965 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CD40LGP29965 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CD40LGP29965 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CD40LGP29965 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
CD40LGP29965 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CD40LGP29965 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
CD40LGP29965 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CD40LGP29965 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CD40LGP29965 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CD40LGP29965 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CD40LGP29965 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CD40LGP29965 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CD40LGP29965 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CD40LGP29965 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CD40LGP29965 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CD40LGP29965 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CD40LGP29965 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CD40LGP29965 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CD40LGP29965 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CD40LGP29965 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CD40LGP29965 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CD40LGP29965 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CD40LGP29965 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CD40LGP29965 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CD40LGP29965 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CD40LGP29965 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CD40LGP29965 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CD40LGP29965 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CD40LGP29965 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CD40LGP29965 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CD40LGP29965 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CD40LGP29965 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CD40LGP29965 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CD40LGP29965 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CD40LGP29965 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CD40LGP29965 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CD40LGP29965 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CD40LGP29965 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CD40LGP29965 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CD40LGP29965 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CD40LGP29965 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CD40LGP29965 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CD40LGP29965 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms