Protein–RNA interactions for Protein: P29033

GJB2, Gap junction beta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB2P29033 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GJB2P29033 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GJB2P29033 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GJB2P29033 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GJB2P29033 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GJB2P29033 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GJB2P29033 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GJB2P29033 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GJB2P29033 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GJB2P29033 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GJB2P29033 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GJB2P29033 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GJB2P29033 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GJB2P29033 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GJB2P29033 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GJB2P29033 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GJB2P29033 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GJB2P29033 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GJB2P29033 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GJB2P29033 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GJB2P29033 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
GJB2P29033 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
GJB2P29033 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
GJB2P29033 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GJB2P29033 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
GJB2P29033 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
GJB2P29033 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
GJB2P29033 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
GJB2P29033 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
GJB2P29033 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GJB2P29033 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GJB2P29033 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GJB2P29033 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GJB2P29033 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GJB2P29033 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GJB2P29033 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GJB2P29033 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GJB2P29033 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
GJB2P29033 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GJB2P29033 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GJB2P29033 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GJB2P29033 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GJB2P29033 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GJB2P29033 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GJB2P29033 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GJB2P29033 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GJB2P29033 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GJB2P29033 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GJB2P29033 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GJB2P29033 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GJB2P29033 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GJB2P29033 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GJB2P29033 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GJB2P29033 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GJB2P29033 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GJB2P29033 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GJB2P29033 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GJB2P29033 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GJB2P29033 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GJB2P29033 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GJB2P29033 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GJB2P29033 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GJB2P29033 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GJB2P29033 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GJB2P29033 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GJB2P29033 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GJB2P29033 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GJB2P29033 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GJB2P29033 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GJB2P29033 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GJB2P29033 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GJB2P29033 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GJB2P29033 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GJB2P29033 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GJB2P29033 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GJB2P29033 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GJB2P29033 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GJB2P29033 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GJB2P29033 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GJB2P29033 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GJB2P29033 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GJB2P29033 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GJB2P29033 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
GJB2P29033 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GJB2P29033 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GJB2P29033 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GJB2P29033 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GJB2P29033 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GJB2P29033 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GJB2P29033 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GJB2P29033 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GJB2P29033 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GJB2P29033 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GJB2P29033 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GJB2P29033 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GJB2P29033 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GJB2P29033 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GJB2P29033 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GJB2P29033 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GJB2P29033 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms