Protein–RNA interactions for Protein: P20851

C4BPB, C4b-binding protein beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4BPBP20851 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
C4BPBP20851 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C4BPBP20851 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C4BPBP20851 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
C4BPBP20851 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C4BPBP20851 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
C4BPBP20851 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C4BPBP20851 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C4BPBP20851 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C4BPBP20851 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C4BPBP20851 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C4BPBP20851 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C4BPBP20851 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C4BPBP20851 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C4BPBP20851 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C4BPBP20851 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
C4BPBP20851 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
C4BPBP20851 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
C4BPBP20851 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
C4BPBP20851 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
C4BPBP20851 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
C4BPBP20851 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C4BPBP20851 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C4BPBP20851 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
C4BPBP20851 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C4BPBP20851 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C4BPBP20851 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C4BPBP20851 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
C4BPBP20851 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
C4BPBP20851 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C4BPBP20851 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
C4BPBP20851 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C4BPBP20851 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C4BPBP20851 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
C4BPBP20851 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
C4BPBP20851 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
C4BPBP20851 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
C4BPBP20851 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
C4BPBP20851 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
C4BPBP20851 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
C4BPBP20851 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
C4BPBP20851 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
C4BPBP20851 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
C4BPBP20851 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
C4BPBP20851 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
C4BPBP20851 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
C4BPBP20851 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
C4BPBP20851 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
C4BPBP20851 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
C4BPBP20851 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C4BPBP20851 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C4BPBP20851 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C4BPBP20851 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C4BPBP20851 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C4BPBP20851 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C4BPBP20851 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C4BPBP20851 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C4BPBP20851 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C4BPBP20851 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C4BPBP20851 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C4BPBP20851 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C4BPBP20851 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C4BPBP20851 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C4BPBP20851 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C4BPBP20851 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C4BPBP20851 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C4BPBP20851 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C4BPBP20851 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C4BPBP20851 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
C4BPBP20851 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C4BPBP20851 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C4BPBP20851 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C4BPBP20851 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C4BPBP20851 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C4BPBP20851 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C4BPBP20851 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C4BPBP20851 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C4BPBP20851 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C4BPBP20851 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C4BPBP20851 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C4BPBP20851 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C4BPBP20851 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C4BPBP20851 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C4BPBP20851 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C4BPBP20851 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
C4BPBP20851 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C4BPBP20851 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C4BPBP20851 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C4BPBP20851 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
C4BPBP20851 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C4BPBP20851 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C4BPBP20851 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C4BPBP20851 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C4BPBP20851 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C4BPBP20851 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C4BPBP20851 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C4BPBP20851 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C4BPBP20851 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C4BPBP20851 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C4BPBP20851 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.7 ms