Protein–RNA interactions for Protein: P20700

LMNB1, Lamin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNB1P20700 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
LMNB1P20700 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
LMNB1P20700 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
LMNB1P20700 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
LMNB1P20700 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
LMNB1P20700 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
LMNB1P20700 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
LMNB1P20700 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
LMNB1P20700 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
LMNB1P20700 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
LMNB1P20700 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
LMNB1P20700 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
LMNB1P20700 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
LMNB1P20700 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
LMNB1P20700 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
LMNB1P20700 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
LMNB1P20700 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
LMNB1P20700 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
LMNB1P20700 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LMNB1P20700 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LMNB1P20700 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LMNB1P20700 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
LMNB1P20700 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
LMNB1P20700 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
LMNB1P20700 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
LMNB1P20700 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LMNB1P20700 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
LMNB1P20700 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LMNB1P20700 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LMNB1P20700 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LMNB1P20700 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LMNB1P20700 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LMNB1P20700 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
LMNB1P20700 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LMNB1P20700 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
LMNB1P20700 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
LMNB1P20700 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LMNB1P20700 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC26.12■■□□□ 1.77
LMNB1P20700 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
LMNB1P20700 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
LMNB1P20700 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
LMNB1P20700 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
LMNB1P20700 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LMNB1P20700 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
LMNB1P20700 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
LMNB1P20700 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
LMNB1P20700 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
LMNB1P20700 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
LMNB1P20700 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LMNB1P20700 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
LMNB1P20700 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
LMNB1P20700 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
LMNB1P20700 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
LMNB1P20700 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LMNB1P20700 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LMNB1P20700 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LMNB1P20700 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LMNB1P20700 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
LMNB1P20700 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LMNB1P20700 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LMNB1P20700 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LMNB1P20700 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LMNB1P20700 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
LMNB1P20700 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
LMNB1P20700 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
LMNB1P20700 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
LMNB1P20700 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LMNB1P20700 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LMNB1P20700 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
LMNB1P20700 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
LMNB1P20700 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
LMNB1P20700 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
LMNB1P20700 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LMNB1P20700 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LMNB1P20700 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
LMNB1P20700 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
LMNB1P20700 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LMNB1P20700 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LMNB1P20700 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LMNB1P20700 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
LMNB1P20700 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LMNB1P20700 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LMNB1P20700 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LMNB1P20700 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LMNB1P20700 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LMNB1P20700 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
LMNB1P20700 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
LMNB1P20700 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
LMNB1P20700 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
LMNB1P20700 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LMNB1P20700 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
LMNB1P20700 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LMNB1P20700 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LMNB1P20700 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LMNB1P20700 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
LMNB1P20700 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
LMNB1P20700 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
LMNB1P20700 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC26.07■■□□□ 1.76
LMNB1P20700 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
LMNB1P20700 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms