Protein–RNA interactions for Protein: P13645

KRT10, Keratin, type I cytoskeletal 10, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT10P13645 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KRT10P13645 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KRT10P13645 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KRT10P13645 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KRT10P13645 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KRT10P13645 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.15
KRT10P13645 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KRT10P13645 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KRT10P13645 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KRT10P13645 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KRT10P13645 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KRT10P13645 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
KRT10P13645 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KRT10P13645 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KRT10P13645 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KRT10P13645 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KRT10P13645 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KRT10P13645 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KRT10P13645 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KRT10P13645 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KRT10P13645 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KRT10P13645 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KRT10P13645 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KRT10P13645 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KRT10P13645 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KRT10P13645 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KRT10P13645 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KRT10P13645 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
KRT10P13645 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KRT10P13645 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KRT10P13645 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KRT10P13645 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KRT10P13645 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KRT10P13645 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KRT10P13645 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KRT10P13645 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KRT10P13645 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KRT10P13645 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KRT10P13645 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KRT10P13645 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KRT10P13645 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KRT10P13645 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KRT10P13645 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KRT10P13645 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
KRT10P13645 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KRT10P13645 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KRT10P13645 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KRT10P13645 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KRT10P13645 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KRT10P13645 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KRT10P13645 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT10P13645 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT10P13645 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT10P13645 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT10P13645 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT10P13645 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT10P13645 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT10P13645 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT10P13645 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT10P13645 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT10P13645 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT10P13645 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT10P13645 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT10P13645 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT10P13645 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT10P13645 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT10P13645 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT10P13645 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT10P13645 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT10P13645 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT10P13645 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT10P13645 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRT10P13645 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRT10P13645 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRT10P13645 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRT10P13645 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRT10P13645 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRT10P13645 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRT10P13645 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRT10P13645 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRT10P13645 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRT10P13645 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRT10P13645 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRT10P13645 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRT10P13645 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRT10P13645 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRT10P13645 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRT10P13645 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
KRT10P13645 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRT10P13645 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRT10P13645 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRT10P13645 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRT10P13645 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRT10P13645 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRT10P13645 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRT10P13645 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRT10P13645 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRT10P13645 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRT10P13645 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
KRT10P13645 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms