Protein–RNA interactions for Protein: P0DI80

SMIM6, Small integral membrane protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM6P0DI80 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SMIM6P0DI80 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SMIM6P0DI80 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SMIM6P0DI80 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMIM6P0DI80 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMIM6P0DI80 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMIM6P0DI80 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMIM6P0DI80 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMIM6P0DI80 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMIM6P0DI80 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMIM6P0DI80 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMIM6P0DI80 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMIM6P0DI80 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMIM6P0DI80 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMIM6P0DI80 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMIM6P0DI80 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMIM6P0DI80 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMIM6P0DI80 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMIM6P0DI80 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMIM6P0DI80 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMIM6P0DI80 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMIM6P0DI80 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMIM6P0DI80 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMIM6P0DI80 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMIM6P0DI80 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMIM6P0DI80 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SMIM6P0DI80 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMIM6P0DI80 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMIM6P0DI80 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMIM6P0DI80 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMIM6P0DI80 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMIM6P0DI80 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMIM6P0DI80 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMIM6P0DI80 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMIM6P0DI80 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMIM6P0DI80 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMIM6P0DI80 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SMIM6P0DI80 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMIM6P0DI80 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMIM6P0DI80 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMIM6P0DI80 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMIM6P0DI80 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMIM6P0DI80 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMIM6P0DI80 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMIM6P0DI80 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SMIM6P0DI80 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMIM6P0DI80 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMIM6P0DI80 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMIM6P0DI80 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMIM6P0DI80 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMIM6P0DI80 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMIM6P0DI80 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMIM6P0DI80 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMIM6P0DI80 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMIM6P0DI80 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMIM6P0DI80 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMIM6P0DI80 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMIM6P0DI80 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMIM6P0DI80 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMIM6P0DI80 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMIM6P0DI80 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMIM6P0DI80 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SMIM6P0DI80 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMIM6P0DI80 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMIM6P0DI80 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMIM6P0DI80 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMIM6P0DI80 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMIM6P0DI80 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMIM6P0DI80 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMIM6P0DI80 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMIM6P0DI80 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMIM6P0DI80 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMIM6P0DI80 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMIM6P0DI80 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMIM6P0DI80 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMIM6P0DI80 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMIM6P0DI80 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMIM6P0DI80 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMIM6P0DI80 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMIM6P0DI80 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMIM6P0DI80 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMIM6P0DI80 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMIM6P0DI80 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMIM6P0DI80 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMIM6P0DI80 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMIM6P0DI80 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMIM6P0DI80 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMIM6P0DI80 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMIM6P0DI80 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMIM6P0DI80 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMIM6P0DI80 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMIM6P0DI80 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMIM6P0DI80 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMIM6P0DI80 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMIM6P0DI80 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMIM6P0DI80 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMIM6P0DI80 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMIM6P0DI80 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMIM6P0DI80 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMIM6P0DI80 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms