Protein–RNA interactions for Protein: P0C7M3

SFTA3, Surfactant-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTA3P0C7M3 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SFTA3P0C7M3 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SFTA3P0C7M3 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SFTA3P0C7M3 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
SFTA3P0C7M3 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SFTA3P0C7M3 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SFTA3P0C7M3 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SFTA3P0C7M3 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SFTA3P0C7M3 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SFTA3P0C7M3 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SFTA3P0C7M3 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SFTA3P0C7M3 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SFTA3P0C7M3 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SFTA3P0C7M3 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SFTA3P0C7M3 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SFTA3P0C7M3 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SFTA3P0C7M3 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SFTA3P0C7M3 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SFTA3P0C7M3 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SFTA3P0C7M3 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SFTA3P0C7M3 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SFTA3P0C7M3 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SFTA3P0C7M3 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SFTA3P0C7M3 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SFTA3P0C7M3 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SFTA3P0C7M3 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SFTA3P0C7M3 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SFTA3P0C7M3 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SFTA3P0C7M3 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SFTA3P0C7M3 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SFTA3P0C7M3 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SFTA3P0C7M3 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SFTA3P0C7M3 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SFTA3P0C7M3 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SFTA3P0C7M3 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SFTA3P0C7M3 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SFTA3P0C7M3 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
SFTA3P0C7M3 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SFTA3P0C7M3 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SFTA3P0C7M3 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SFTA3P0C7M3 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SFTA3P0C7M3 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SFTA3P0C7M3 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SFTA3P0C7M3 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SFTA3P0C7M3 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SFTA3P0C7M3 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SFTA3P0C7M3 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SFTA3P0C7M3 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SFTA3P0C7M3 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SFTA3P0C7M3 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SFTA3P0C7M3 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SFTA3P0C7M3 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SFTA3P0C7M3 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SFTA3P0C7M3 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SFTA3P0C7M3 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SFTA3P0C7M3 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SFTA3P0C7M3 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SFTA3P0C7M3 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SFTA3P0C7M3 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SFTA3P0C7M3 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SFTA3P0C7M3 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SFTA3P0C7M3 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SFTA3P0C7M3 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SFTA3P0C7M3 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SFTA3P0C7M3 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SFTA3P0C7M3 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SFTA3P0C7M3 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SFTA3P0C7M3 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SFTA3P0C7M3 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SFTA3P0C7M3 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SFTA3P0C7M3 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SFTA3P0C7M3 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SFTA3P0C7M3 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SFTA3P0C7M3 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SFTA3P0C7M3 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SFTA3P0C7M3 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SFTA3P0C7M3 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SFTA3P0C7M3 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SFTA3P0C7M3 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
SFTA3P0C7M3 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SFTA3P0C7M3 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SFTA3P0C7M3 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SFTA3P0C7M3 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SFTA3P0C7M3 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SFTA3P0C7M3 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SFTA3P0C7M3 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SFTA3P0C7M3 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
SFTA3P0C7M3 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SFTA3P0C7M3 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SFTA3P0C7M3 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
SFTA3P0C7M3 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
SFTA3P0C7M3 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SFTA3P0C7M3 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SFTA3P0C7M3 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SFTA3P0C7M3 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SFTA3P0C7M3 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SFTA3P0C7M3 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SFTA3P0C7M3 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SFTA3P0C7M3 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SFTA3P0C7M3 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms