Protein–RNA interactions for Protein: O95263

PDE8B, High affinity cAMP-specific and IBMX-insensitive 3',5'-cyclic phosphodiesterase 8B, humanhuman

Predictions only

Length 885 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE8BO95263 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
PDE8BO95263 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PDE8BO95263 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PDE8BO95263 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PDE8BO95263 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PDE8BO95263 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PDE8BO95263 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PDE8BO95263 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PDE8BO95263 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PDE8BO95263 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PDE8BO95263 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PDE8BO95263 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PDE8BO95263 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PDE8BO95263 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PDE8BO95263 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PDE8BO95263 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PDE8BO95263 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PDE8BO95263 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
PDE8BO95263 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PDE8BO95263 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PDE8BO95263 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PDE8BO95263 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PDE8BO95263 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PDE8BO95263 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PDE8BO95263 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PDE8BO95263 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PDE8BO95263 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PDE8BO95263 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
PDE8BO95263 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PDE8BO95263 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PDE8BO95263 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PDE8BO95263 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
PDE8BO95263 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PDE8BO95263 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PDE8BO95263 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PDE8BO95263 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PDE8BO95263 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PDE8BO95263 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PDE8BO95263 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PDE8BO95263 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PDE8BO95263 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PDE8BO95263 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
PDE8BO95263 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PDE8BO95263 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PDE8BO95263 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PDE8BO95263 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PDE8BO95263 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PDE8BO95263 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PDE8BO95263 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PDE8BO95263 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PDE8BO95263 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PDE8BO95263 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PDE8BO95263 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PDE8BO95263 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PDE8BO95263 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PDE8BO95263 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PDE8BO95263 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PDE8BO95263 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PDE8BO95263 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PDE8BO95263 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PDE8BO95263 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PDE8BO95263 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PDE8BO95263 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PDE8BO95263 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PDE8BO95263 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PDE8BO95263 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PDE8BO95263 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PDE8BO95263 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PDE8BO95263 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
PDE8BO95263 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PDE8BO95263 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PDE8BO95263 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PDE8BO95263 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PDE8BO95263 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PDE8BO95263 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PDE8BO95263 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PDE8BO95263 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PDE8BO95263 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PDE8BO95263 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PDE8BO95263 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PDE8BO95263 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PDE8BO95263 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PDE8BO95263 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PDE8BO95263 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PDE8BO95263 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PDE8BO95263 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PDE8BO95263 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
PDE8BO95263 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
PDE8BO95263 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PDE8BO95263 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PDE8BO95263 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
PDE8BO95263 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PDE8BO95263 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PDE8BO95263 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PDE8BO95263 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PDE8BO95263 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PDE8BO95263 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PDE8BO95263 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PDE8BO95263 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PDE8BO95263 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms