Protein–RNA interactions for Protein: O60902

SHOX2, Short stature homeobox protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHOX2O60902 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SHOX2O60902 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SHOX2O60902 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SHOX2O60902 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SHOX2O60902 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SHOX2O60902 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SHOX2O60902 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SHOX2O60902 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SHOX2O60902 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SHOX2O60902 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SHOX2O60902 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SHOX2O60902 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SHOX2O60902 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SHOX2O60902 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SHOX2O60902 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SHOX2O60902 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SHOX2O60902 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SHOX2O60902 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SHOX2O60902 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SHOX2O60902 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SHOX2O60902 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SHOX2O60902 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SHOX2O60902 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SHOX2O60902 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SHOX2O60902 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SHOX2O60902 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SHOX2O60902 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SHOX2O60902 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SHOX2O60902 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SHOX2O60902 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SHOX2O60902 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SHOX2O60902 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SHOX2O60902 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SHOX2O60902 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SHOX2O60902 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SHOX2O60902 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SHOX2O60902 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SHOX2O60902 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SHOX2O60902 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SHOX2O60902 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SHOX2O60902 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SHOX2O60902 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SHOX2O60902 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SHOX2O60902 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SHOX2O60902 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SHOX2O60902 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SHOX2O60902 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SHOX2O60902 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SHOX2O60902 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SHOX2O60902 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SHOX2O60902 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SHOX2O60902 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SHOX2O60902 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SHOX2O60902 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SHOX2O60902 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SHOX2O60902 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SHOX2O60902 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SHOX2O60902 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SHOX2O60902 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SHOX2O60902 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SHOX2O60902 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SHOX2O60902 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SHOX2O60902 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SHOX2O60902 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SHOX2O60902 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SHOX2O60902 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SHOX2O60902 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SHOX2O60902 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SHOX2O60902 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SHOX2O60902 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SHOX2O60902 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SHOX2O60902 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SHOX2O60902 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SHOX2O60902 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SHOX2O60902 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SHOX2O60902 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SHOX2O60902 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SHOX2O60902 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SHOX2O60902 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SHOX2O60902 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SHOX2O60902 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SHOX2O60902 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SHOX2O60902 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SHOX2O60902 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SHOX2O60902 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SHOX2O60902 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SHOX2O60902 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SHOX2O60902 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SHOX2O60902 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SHOX2O60902 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SHOX2O60902 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SHOX2O60902 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SHOX2O60902 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SHOX2O60902 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SHOX2O60902 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SHOX2O60902 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SHOX2O60902 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SHOX2O60902 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SHOX2O60902 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SHOX2O60902 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms