Protein–RNA interactions for Protein: O43716

GATC, Glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit C, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATCO43716 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
GATCO43716 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
GATCO43716 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
GATCO43716 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
GATCO43716 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GATCO43716 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GATCO43716 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GATCO43716 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GATCO43716 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GATCO43716 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GATCO43716 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GATCO43716 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GATCO43716 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GATCO43716 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GATCO43716 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GATCO43716 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GATCO43716 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GATCO43716 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GATCO43716 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GATCO43716 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GATCO43716 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GATCO43716 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GATCO43716 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GATCO43716 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GATCO43716 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GATCO43716 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GATCO43716 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GATCO43716 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GATCO43716 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GATCO43716 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GATCO43716 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GATCO43716 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GATCO43716 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GATCO43716 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GATCO43716 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GATCO43716 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GATCO43716 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GATCO43716 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GATCO43716 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GATCO43716 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GATCO43716 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GATCO43716 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GATCO43716 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GATCO43716 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GATCO43716 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GATCO43716 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GATCO43716 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GATCO43716 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GATCO43716 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GATCO43716 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GATCO43716 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GATCO43716 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GATCO43716 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GATCO43716 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GATCO43716 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GATCO43716 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GATCO43716 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GATCO43716 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GATCO43716 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GATCO43716 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GATCO43716 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GATCO43716 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GATCO43716 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GATCO43716 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GATCO43716 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GATCO43716 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
GATCO43716 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
GATCO43716 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GATCO43716 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GATCO43716 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GATCO43716 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GATCO43716 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GATCO43716 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GATCO43716 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GATCO43716 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GATCO43716 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GATCO43716 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GATCO43716 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GATCO43716 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GATCO43716 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GATCO43716 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GATCO43716 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GATCO43716 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GATCO43716 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GATCO43716 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GATCO43716 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GATCO43716 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GATCO43716 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GATCO43716 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GATCO43716 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GATCO43716 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GATCO43716 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GATCO43716 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GATCO43716 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GATCO43716 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GATCO43716 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GATCO43716 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GATCO43716 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GATCO43716 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GATCO43716 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms