Protein–RNA interactions for Protein: O43405

COCH, Cochlin, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COCHO43405 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
COCHO43405 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
COCHO43405 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
COCHO43405 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
COCHO43405 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
COCHO43405 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
COCHO43405 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
COCHO43405 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
COCHO43405 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
COCHO43405 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
COCHO43405 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
COCHO43405 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
COCHO43405 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
COCHO43405 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
COCHO43405 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
COCHO43405 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
COCHO43405 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
COCHO43405 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
COCHO43405 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
COCHO43405 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
COCHO43405 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
COCHO43405 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
COCHO43405 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
COCHO43405 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
COCHO43405 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
COCHO43405 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
COCHO43405 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
COCHO43405 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
COCHO43405 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
COCHO43405 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
COCHO43405 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
COCHO43405 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
COCHO43405 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
COCHO43405 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
COCHO43405 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
COCHO43405 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
COCHO43405 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
COCHO43405 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
COCHO43405 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
COCHO43405 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
COCHO43405 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
COCHO43405 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
COCHO43405 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
COCHO43405 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
COCHO43405 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
COCHO43405 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
COCHO43405 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
COCHO43405 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
COCHO43405 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
COCHO43405 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
COCHO43405 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
COCHO43405 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
COCHO43405 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COCHO43405 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COCHO43405 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COCHO43405 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COCHO43405 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
COCHO43405 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COCHO43405 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
COCHO43405 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COCHO43405 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COCHO43405 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
COCHO43405 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
COCHO43405 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COCHO43405 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
COCHO43405 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COCHO43405 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
COCHO43405 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
COCHO43405 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COCHO43405 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
COCHO43405 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COCHO43405 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
COCHO43405 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COCHO43405 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COCHO43405 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COCHO43405 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COCHO43405 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COCHO43405 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
COCHO43405 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
COCHO43405 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
COCHO43405 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
COCHO43405 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
COCHO43405 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
COCHO43405 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COCHO43405 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COCHO43405 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
COCHO43405 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COCHO43405 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
COCHO43405 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
COCHO43405 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COCHO43405 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COCHO43405 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COCHO43405 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
COCHO43405 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COCHO43405 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
COCHO43405 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COCHO43405 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
COCHO43405 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COCHO43405 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
COCHO43405 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms