Protein–RNA interactions for Protein: O15397

IPO8, Importin-8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,037 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IPO8O15397 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
IPO8O15397 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
IPO8O15397 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
IPO8O15397 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
IPO8O15397 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
IPO8O15397 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
IPO8O15397 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
IPO8O15397 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
IPO8O15397 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
IPO8O15397 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
IPO8O15397 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
IPO8O15397 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
IPO8O15397 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
IPO8O15397 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
IPO8O15397 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
IPO8O15397 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
IPO8O15397 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
IPO8O15397 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
IPO8O15397 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
IPO8O15397 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
IPO8O15397 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
IPO8O15397 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
IPO8O15397 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
IPO8O15397 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
IPO8O15397 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
IPO8O15397 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
IPO8O15397 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
IPO8O15397 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
IPO8O15397 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
IPO8O15397 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
IPO8O15397 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
IPO8O15397 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
IPO8O15397 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
IPO8O15397 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
IPO8O15397 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
IPO8O15397 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
IPO8O15397 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
IPO8O15397 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
IPO8O15397 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.95
IPO8O15397 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
IPO8O15397 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
IPO8O15397 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
IPO8O15397 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
IPO8O15397 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
IPO8O15397 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
IPO8O15397 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
IPO8O15397 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
IPO8O15397 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
IPO8O15397 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
IPO8O15397 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
IPO8O15397 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
IPO8O15397 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
IPO8O15397 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
IPO8O15397 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
IPO8O15397 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC27.19■■□□□ 1.94
IPO8O15397 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
IPO8O15397 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
IPO8O15397 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
IPO8O15397 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
IPO8O15397 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
IPO8O15397 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
IPO8O15397 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
IPO8O15397 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
IPO8O15397 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
IPO8O15397 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
IPO8O15397 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
IPO8O15397 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
IPO8O15397 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
IPO8O15397 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
IPO8O15397 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
IPO8O15397 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
IPO8O15397 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
IPO8O15397 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
IPO8O15397 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
IPO8O15397 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
IPO8O15397 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
IPO8O15397 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
IPO8O15397 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
IPO8O15397 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
IPO8O15397 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
IPO8O15397 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
IPO8O15397 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
IPO8O15397 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
IPO8O15397 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
IPO8O15397 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
IPO8O15397 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
IPO8O15397 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
IPO8O15397 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
IPO8O15397 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
IPO8O15397 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
IPO8O15397 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
IPO8O15397 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
IPO8O15397 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
IPO8O15397 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
IPO8O15397 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
IPO8O15397 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
IPO8O15397 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
IPO8O15397 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
IPO8O15397 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
IPO8O15397 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms