Protein–RNA interactions for Protein: O15269

SPTLC1, Serine palmitoyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTLC1O15269 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPTLC1O15269 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
SPTLC1O15269 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SPTLC1O15269 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SPTLC1O15269 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SPTLC1O15269 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SPTLC1O15269 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SPTLC1O15269 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SPTLC1O15269 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SPTLC1O15269 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SPTLC1O15269 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SPTLC1O15269 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SPTLC1O15269 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPTLC1O15269 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPTLC1O15269 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPTLC1O15269 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPTLC1O15269 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPTLC1O15269 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPTLC1O15269 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPTLC1O15269 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPTLC1O15269 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SPTLC1O15269 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPTLC1O15269 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPTLC1O15269 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPTLC1O15269 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPTLC1O15269 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SPTLC1O15269 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPTLC1O15269 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPTLC1O15269 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPTLC1O15269 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPTLC1O15269 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPTLC1O15269 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPTLC1O15269 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPTLC1O15269 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPTLC1O15269 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPTLC1O15269 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPTLC1O15269 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPTLC1O15269 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPTLC1O15269 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPTLC1O15269 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPTLC1O15269 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPTLC1O15269 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPTLC1O15269 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPTLC1O15269 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPTLC1O15269 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPTLC1O15269 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPTLC1O15269 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPTLC1O15269 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPTLC1O15269 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPTLC1O15269 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPTLC1O15269 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPTLC1O15269 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPTLC1O15269 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPTLC1O15269 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPTLC1O15269 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPTLC1O15269 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPTLC1O15269 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPTLC1O15269 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPTLC1O15269 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPTLC1O15269 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPTLC1O15269 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPTLC1O15269 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPTLC1O15269 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPTLC1O15269 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPTLC1O15269 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPTLC1O15269 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPTLC1O15269 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPTLC1O15269 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPTLC1O15269 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPTLC1O15269 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPTLC1O15269 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SPTLC1O15269 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SPTLC1O15269 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPTLC1O15269 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPTLC1O15269 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPTLC1O15269 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPTLC1O15269 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPTLC1O15269 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPTLC1O15269 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPTLC1O15269 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SPTLC1O15269 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPTLC1O15269 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPTLC1O15269 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPTLC1O15269 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPTLC1O15269 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPTLC1O15269 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPTLC1O15269 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPTLC1O15269 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPTLC1O15269 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SPTLC1O15269 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPTLC1O15269 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPTLC1O15269 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPTLC1O15269 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPTLC1O15269 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPTLC1O15269 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPTLC1O15269 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPTLC1O15269 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPTLC1O15269 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPTLC1O15269 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPTLC1O15269 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms