Protein–RNA interactions for Protein: O14828

SCAMP3, Secretory carrier-associated membrane protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP3O14828 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCAMP3O14828 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCAMP3O14828 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCAMP3O14828 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCAMP3O14828 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCAMP3O14828 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCAMP3O14828 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCAMP3O14828 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCAMP3O14828 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCAMP3O14828 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCAMP3O14828 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCAMP3O14828 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCAMP3O14828 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCAMP3O14828 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCAMP3O14828 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCAMP3O14828 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCAMP3O14828 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCAMP3O14828 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCAMP3O14828 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCAMP3O14828 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCAMP3O14828 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCAMP3O14828 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCAMP3O14828 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCAMP3O14828 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCAMP3O14828 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCAMP3O14828 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCAMP3O14828 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCAMP3O14828 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCAMP3O14828 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCAMP3O14828 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCAMP3O14828 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCAMP3O14828 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCAMP3O14828 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCAMP3O14828 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCAMP3O14828 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCAMP3O14828 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCAMP3O14828 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCAMP3O14828 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SCAMP3O14828 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCAMP3O14828 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCAMP3O14828 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCAMP3O14828 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCAMP3O14828 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCAMP3O14828 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCAMP3O14828 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCAMP3O14828 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SCAMP3O14828 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SCAMP3O14828 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SCAMP3O14828 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SCAMP3O14828 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SCAMP3O14828 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SCAMP3O14828 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SCAMP3O14828 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SCAMP3O14828 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SCAMP3O14828 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SCAMP3O14828 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SCAMP3O14828 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCAMP3O14828 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCAMP3O14828 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCAMP3O14828 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCAMP3O14828 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCAMP3O14828 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCAMP3O14828 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCAMP3O14828 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCAMP3O14828 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCAMP3O14828 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SCAMP3O14828 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCAMP3O14828 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCAMP3O14828 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SCAMP3O14828 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCAMP3O14828 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCAMP3O14828 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCAMP3O14828 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCAMP3O14828 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCAMP3O14828 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCAMP3O14828 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCAMP3O14828 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCAMP3O14828 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCAMP3O14828 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCAMP3O14828 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCAMP3O14828 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCAMP3O14828 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCAMP3O14828 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCAMP3O14828 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCAMP3O14828 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCAMP3O14828 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SCAMP3O14828 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCAMP3O14828 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCAMP3O14828 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCAMP3O14828 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCAMP3O14828 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCAMP3O14828 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCAMP3O14828 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCAMP3O14828 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCAMP3O14828 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCAMP3O14828 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCAMP3O14828 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCAMP3O14828 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCAMP3O14828 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCAMP3O14828 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms