Protein–RNA interactions for Protein: O00716

E2F3, Transcription factor E2F3, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F3O00716 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
E2F3O00716 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
E2F3O00716 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
E2F3O00716 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
E2F3O00716 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
E2F3O00716 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
E2F3O00716 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
E2F3O00716 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
E2F3O00716 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
E2F3O00716 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
E2F3O00716 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
E2F3O00716 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
E2F3O00716 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
E2F3O00716 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
E2F3O00716 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC20.81■□□□□ 0.92
E2F3O00716 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
E2F3O00716 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
E2F3O00716 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
E2F3O00716 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC20.81■□□□□ 0.92
E2F3O00716 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
E2F3O00716 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
E2F3O00716 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
E2F3O00716 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
E2F3O00716 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
E2F3O00716 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
E2F3O00716 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
E2F3O00716 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
E2F3O00716 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
E2F3O00716 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
E2F3O00716 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
E2F3O00716 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
E2F3O00716 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
E2F3O00716 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
E2F3O00716 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
E2F3O00716 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
E2F3O00716 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
E2F3O00716 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
E2F3O00716 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
E2F3O00716 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
E2F3O00716 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
E2F3O00716 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
E2F3O00716 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
E2F3O00716 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
E2F3O00716 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
E2F3O00716 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
E2F3O00716 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
E2F3O00716 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
E2F3O00716 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
E2F3O00716 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
E2F3O00716 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
E2F3O00716 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
E2F3O00716 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
E2F3O00716 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
E2F3O00716 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
E2F3O00716 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
E2F3O00716 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
E2F3O00716 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
E2F3O00716 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
E2F3O00716 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
E2F3O00716 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
E2F3O00716 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
E2F3O00716 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
E2F3O00716 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
E2F3O00716 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
E2F3O00716 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
E2F3O00716 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
E2F3O00716 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
E2F3O00716 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
E2F3O00716 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
E2F3O00716 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
E2F3O00716 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
E2F3O00716 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
E2F3O00716 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
E2F3O00716 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
E2F3O00716 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
E2F3O00716 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
E2F3O00716 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
E2F3O00716 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
E2F3O00716 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
E2F3O00716 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
E2F3O00716 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
E2F3O00716 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
E2F3O00716 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
E2F3O00716 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
E2F3O00716 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC20.76■□□□□ 0.91
E2F3O00716 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
E2F3O00716 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
E2F3O00716 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
E2F3O00716 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
E2F3O00716 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
E2F3O00716 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
E2F3O00716 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
E2F3O00716 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
E2F3O00716 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
E2F3O00716 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
E2F3O00716 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
E2F3O00716 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
E2F3O00716 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC20.75■□□□□ 0.91
E2F3O00716 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
E2F3O00716 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.9 ms