Protein–RNA interactions for Protein: O00291

HIP1, Huntingtin-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,037 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIP1O00291 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
HIP1O00291 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
HIP1O00291 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
HIP1O00291 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
HIP1O00291 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
HIP1O00291 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
HIP1O00291 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
HIP1O00291 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
HIP1O00291 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
HIP1O00291 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
HIP1O00291 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
HIP1O00291 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
HIP1O00291 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
HIP1O00291 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
HIP1O00291 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
HIP1O00291 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HIP1O00291 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HIP1O00291 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HIP1O00291 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HIP1O00291 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HIP1O00291 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HIP1O00291 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HIP1O00291 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HIP1O00291 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HIP1O00291 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HIP1O00291 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
HIP1O00291 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
HIP1O00291 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
HIP1O00291 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
HIP1O00291 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
HIP1O00291 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
HIP1O00291 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
HIP1O00291 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HIP1O00291 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HIP1O00291 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HIP1O00291 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HIP1O00291 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
HIP1O00291 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
HIP1O00291 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
HIP1O00291 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HIP1O00291 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HIP1O00291 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
HIP1O00291 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
HIP1O00291 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HIP1O00291 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
HIP1O00291 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
HIP1O00291 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
HIP1O00291 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HIP1O00291 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
HIP1O00291 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HIP1O00291 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HIP1O00291 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HIP1O00291 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
HIP1O00291 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HIP1O00291 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HIP1O00291 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HIP1O00291 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HIP1O00291 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HIP1O00291 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HIP1O00291 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HIP1O00291 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HIP1O00291 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HIP1O00291 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HIP1O00291 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HIP1O00291 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HIP1O00291 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HIP1O00291 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HIP1O00291 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HIP1O00291 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HIP1O00291 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HIP1O00291 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HIP1O00291 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HIP1O00291 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
HIP1O00291 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
HIP1O00291 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
HIP1O00291 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.71
HIP1O00291 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
HIP1O00291 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
HIP1O00291 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
HIP1O00291 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
HIP1O00291 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
HIP1O00291 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
HIP1O00291 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
HIP1O00291 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
HIP1O00291 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
HIP1O00291 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
HIP1O00291 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
HIP1O00291 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HIP1O00291 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HIP1O00291 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
HIP1O00291 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
HIP1O00291 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
HIP1O00291 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
HIP1O00291 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HIP1O00291 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
HIP1O00291 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HIP1O00291 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HIP1O00291 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
HIP1O00291 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HIP1O00291 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms