Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HMGB1P1B2RPK0 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HMGB1P1B2RPK0 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HMGB1P1B2RPK0 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HMGB1P1B2RPK0 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HMGB1P1B2RPK0 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HMGB1P1B2RPK0 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HMGB1P1B2RPK0 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HMGB1P1B2RPK0 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HMGB1P1B2RPK0 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HMGB1P1B2RPK0 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HMGB1P1B2RPK0 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HMGB1P1B2RPK0 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
HMGB1P1B2RPK0 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
HMGB1P1B2RPK0 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
HMGB1P1B2RPK0 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
HMGB1P1B2RPK0 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HMGB1P1B2RPK0 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HMGB1P1B2RPK0 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HMGB1P1B2RPK0 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HMGB1P1B2RPK0 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HMGB1P1B2RPK0 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HMGB1P1B2RPK0 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HMGB1P1B2RPK0 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HMGB1P1B2RPK0 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HMGB1P1B2RPK0 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HMGB1P1B2RPK0 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HMGB1P1B2RPK0 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HMGB1P1B2RPK0 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HMGB1P1B2RPK0 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HMGB1P1B2RPK0 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HMGB1P1B2RPK0 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
HMGB1P1B2RPK0 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HMGB1P1B2RPK0 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HMGB1P1B2RPK0 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HMGB1P1B2RPK0 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HMGB1P1B2RPK0 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HMGB1P1B2RPK0 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HMGB1P1B2RPK0 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HMGB1P1B2RPK0 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HMGB1P1B2RPK0 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HMGB1P1B2RPK0 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HMGB1P1B2RPK0 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HMGB1P1B2RPK0 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HMGB1P1B2RPK0 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HMGB1P1B2RPK0 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HMGB1P1B2RPK0 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HMGB1P1B2RPK0 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HMGB1P1B2RPK0 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HMGB1P1B2RPK0 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
HMGB1P1B2RPK0 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
HMGB1P1B2RPK0 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HMGB1P1B2RPK0 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HMGB1P1B2RPK0 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HMGB1P1B2RPK0 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HMGB1P1B2RPK0 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HMGB1P1B2RPK0 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HMGB1P1B2RPK0 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HMGB1P1B2RPK0 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HMGB1P1B2RPK0 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HMGB1P1B2RPK0 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HMGB1P1B2RPK0 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HMGB1P1B2RPK0 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HMGB1P1B2RPK0 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HMGB1P1B2RPK0 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HMGB1P1B2RPK0 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HMGB1P1B2RPK0 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HMGB1P1B2RPK0 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HMGB1P1B2RPK0 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HMGB1P1B2RPK0 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HMGB1P1B2RPK0 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HMGB1P1B2RPK0 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HMGB1P1B2RPK0 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HMGB1P1B2RPK0 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HMGB1P1B2RPK0 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HMGB1P1B2RPK0 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HMGB1P1B2RPK0 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HMGB1P1B2RPK0 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HMGB1P1B2RPK0 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HMGB1P1B2RPK0 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HMGB1P1B2RPK0 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HMGB1P1B2RPK0 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HMGB1P1B2RPK0 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HMGB1P1B2RPK0 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
HMGB1P1B2RPK0 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HMGB1P1B2RPK0 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HMGB1P1B2RPK0 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HMGB1P1B2RPK0 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
HMGB1P1B2RPK0 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HMGB1P1B2RPK0 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HMGB1P1B2RPK0 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HMGB1P1B2RPK0 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HMGB1P1B2RPK0 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HMGB1P1B2RPK0 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HMGB1P1B2RPK0 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HMGB1P1B2RPK0 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HMGB1P1B2RPK0 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HMGB1P1B2RPK0 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HMGB1P1B2RPK0 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HMGB1P1B2RPK0 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms