Protein–RNA interactions for Protein: A6NKG5

RTL1, Retrotransposon-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL1A6NKG5 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RTL1A6NKG5 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RTL1A6NKG5 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC28.55■■■□□ 2.16
RTL1A6NKG5 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RTL1A6NKG5 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RTL1A6NKG5 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RTL1A6NKG5 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RTL1A6NKG5 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
RTL1A6NKG5 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RTL1A6NKG5 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RTL1A6NKG5 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
RTL1A6NKG5 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
RTL1A6NKG5 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
RTL1A6NKG5 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
RTL1A6NKG5 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
RTL1A6NKG5 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
RTL1A6NKG5 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RTL1A6NKG5 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
RTL1A6NKG5 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RTL1A6NKG5 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
RTL1A6NKG5 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
RTL1A6NKG5 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
RTL1A6NKG5 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
RTL1A6NKG5 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
RTL1A6NKG5 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
RTL1A6NKG5 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
RTL1A6NKG5 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
RTL1A6NKG5 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
RTL1A6NKG5 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
RTL1A6NKG5 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
RTL1A6NKG5 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RTL1A6NKG5 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RTL1A6NKG5 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
RTL1A6NKG5 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
RTL1A6NKG5 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RTL1A6NKG5 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
RTL1A6NKG5 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RTL1A6NKG5 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
RTL1A6NKG5 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
RTL1A6NKG5 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RTL1A6NKG5 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RTL1A6NKG5 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RTL1A6NKG5 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
RTL1A6NKG5 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.16
RTL1A6NKG5 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
RTL1A6NKG5 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.16
RTL1A6NKG5 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
RTL1A6NKG5 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
RTL1A6NKG5 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RTL1A6NKG5 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
RTL1A6NKG5 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC28.5■■■□□ 2.15
RTL1A6NKG5 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RTL1A6NKG5 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RTL1A6NKG5 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
RTL1A6NKG5 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RTL1A6NKG5 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RTL1A6NKG5 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
RTL1A6NKG5 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RTL1A6NKG5 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RTL1A6NKG5 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
RTL1A6NKG5 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RTL1A6NKG5 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RTL1A6NKG5 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RTL1A6NKG5 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RTL1A6NKG5 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
RTL1A6NKG5 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
RTL1A6NKG5 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
RTL1A6NKG5 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
RTL1A6NKG5 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
RTL1A6NKG5 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
RTL1A6NKG5 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
RTL1A6NKG5 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
RTL1A6NKG5 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC28.49■■■□□ 2.15
RTL1A6NKG5 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
RTL1A6NKG5 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
RTL1A6NKG5 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
RTL1A6NKG5 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
RTL1A6NKG5 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RTL1A6NKG5 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
RTL1A6NKG5 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
RTL1A6NKG5 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
RTL1A6NKG5 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
RTL1A6NKG5 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
RTL1A6NKG5 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
RTL1A6NKG5 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
RTL1A6NKG5 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
RTL1A6NKG5 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
RTL1A6NKG5 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
RTL1A6NKG5 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RTL1A6NKG5 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RTL1A6NKG5 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RTL1A6NKG5 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RTL1A6NKG5 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
RTL1A6NKG5 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
RTL1A6NKG5 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RTL1A6NKG5 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC28.47■■■□□ 2.15
RTL1A6NKG5 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
RTL1A6NKG5 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
RTL1A6NKG5 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
RTL1A6NKG5 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms