Protein–RNA interactions for Protein: A4D1F6

LRRD1, Leucine-rich repeat and death domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 860 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRD1A4D1F6 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRRD1A4D1F6 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRRD1A4D1F6 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRRD1A4D1F6 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRRD1A4D1F6 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRRD1A4D1F6 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRRD1A4D1F6 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRRD1A4D1F6 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRRD1A4D1F6 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRRD1A4D1F6 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRRD1A4D1F6 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRRD1A4D1F6 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRRD1A4D1F6 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRRD1A4D1F6 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRRD1A4D1F6 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRRD1A4D1F6 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
LRRD1A4D1F6 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRRD1A4D1F6 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRRD1A4D1F6 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRRD1A4D1F6 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRRD1A4D1F6 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRRD1A4D1F6 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRRD1A4D1F6 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRRD1A4D1F6 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRRD1A4D1F6 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRRD1A4D1F6 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRRD1A4D1F6 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRRD1A4D1F6 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRRD1A4D1F6 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRRD1A4D1F6 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRRD1A4D1F6 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRRD1A4D1F6 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRRD1A4D1F6 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRRD1A4D1F6 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRRD1A4D1F6 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRRD1A4D1F6 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRRD1A4D1F6 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
LRRD1A4D1F6 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
LRRD1A4D1F6 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRRD1A4D1F6 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRRD1A4D1F6 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
LRRD1A4D1F6 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRRD1A4D1F6 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRRD1A4D1F6 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRRD1A4D1F6 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRRD1A4D1F6 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
LRRD1A4D1F6 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRRD1A4D1F6 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRRD1A4D1F6 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRRD1A4D1F6 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRRD1A4D1F6 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
LRRD1A4D1F6 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRRD1A4D1F6 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRRD1A4D1F6 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRRD1A4D1F6 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRRD1A4D1F6 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRRD1A4D1F6 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRRD1A4D1F6 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
LRRD1A4D1F6 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
LRRD1A4D1F6 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRRD1A4D1F6 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRRD1A4D1F6 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRRD1A4D1F6 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRRD1A4D1F6 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRRD1A4D1F6 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRRD1A4D1F6 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRRD1A4D1F6 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRRD1A4D1F6 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRRD1A4D1F6 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRRD1A4D1F6 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRRD1A4D1F6 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRRD1A4D1F6 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRRD1A4D1F6 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRRD1A4D1F6 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRRD1A4D1F6 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRRD1A4D1F6 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRRD1A4D1F6 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRRD1A4D1F6 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRRD1A4D1F6 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
LRRD1A4D1F6 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
LRRD1A4D1F6 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRRD1A4D1F6 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRRD1A4D1F6 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRRD1A4D1F6 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRRD1A4D1F6 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRRD1A4D1F6 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRRD1A4D1F6 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRRD1A4D1F6 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRRD1A4D1F6 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRRD1A4D1F6 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRRD1A4D1F6 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRRD1A4D1F6 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRRD1A4D1F6 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRRD1A4D1F6 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRRD1A4D1F6 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRRD1A4D1F6 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRRD1A4D1F6 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRRD1A4D1F6 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRRD1A4D1F6 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRRD1A4D1F6 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms