Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQZ2

UTP3, Something about silencing protein 10, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP3Q9NQZ2 ZNF766-207ENST00000600016 572 ntTSL 46.09□□□□□ -1.431e-6■■■■■ 46.6
UTP3Q9NQZ2 BTAF1-204ENST00000544642 6938 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.69e-7■■■■■ 46.6
UTP3Q9NQZ2 DLD-203ENST00000417551 2041 ntTSL 54.77□□□□□ -1.651e-6■■■■■ 46.6
UTP3Q9NQZ2 PPP4R1-209ENST00000578329 350 ntTSL 34.73□□□□□ -1.651e-6■■■■■ 46.6
UTP3Q9NQZ2 CDKN2AIP-202ENST00000502924 347 ntTSL 34.32□□□□□ -1.721e-6■■■■■ 46.6
UTP3Q9NQZ2 ANXA11-208ENST00000463657 780 ntTSL 519.73■□□□□ 0.756e-7■■■■■ 46.6
UTP3Q9NQZ2 DHX30-210ENST00000471082 464 ntTSL 37.7□□□□□ -1.182e-6■■■■■ 46.6
UTP3Q9NQZ2 MRE11-201ENST00000323929 6897 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.023e-7■■■■■ 46.6
UTP3Q9NQZ2 MRE11-204ENST00000407439 2684 ntTSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.313e-7■■■■■ 46.6
UTP3Q9NQZ2 MRE11-203ENST00000393241 2604 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.433e-7■■■■■ 46.6
UTP3Q9NQZ2 MRE11-202ENST00000323977 2588 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.483e-7■■■■■ 46.6
UTP3Q9NQZ2 ARFRP1-209ENST00000612772 1375 ntTSL 318.1■□□□□ 0.492e-7■■■■■ 46.6
UTP3Q9NQZ2 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.222e-6■■■■■ 46.6
UTP3Q9NQZ2 SPPL2B-209ENST00000613503 3456 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.012e-6■■■■■ 46.6
UTP3Q9NQZ2 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.334e-7■■■■■ 46.6
UTP3Q9NQZ2 CCAR1-218ENST00000630771 4540 ntTSL 5 BASIC8.28□□□□□ -1.081e-8■■■■■ 46.5
UTP3Q9NQZ2 CCAR1-207ENST00000536012 2447 ntTSL 1 (best)8.14□□□□□ -1.111e-8■■■■■ 46.5
UTP3Q9NQZ2 CCAR1-214ENST00000543225 2407 ntTSL 1 (best)7.41□□□□□ -1.221e-8■■■■■ 46.5
UTP3Q9NQZ2 CCAR1-217ENST00000543719 3521 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.281e-8■■■■■ 46.5
UTP3Q9NQZ2 CCAR1-215ENST00000543229 2475 ntTSL 26.84□□□□□ -1.311e-8■■■■■ 46.5
UTP3Q9NQZ2 CCAR1-201ENST00000265872 4683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.321e-8■■■■■ 46.5
UTP3Q9NQZ2 CCAR1-213ENST00000541012 2432 ntTSL 1 (best)6.71□□□□□ -1.341e-8■■■■■ 46.5
UTP3Q9NQZ2 CCAR1-211ENST00000539539 3224 ntTSL 24.57□□□□□ -1.681e-8■■■■■ 46.5
UTP3Q9NQZ2 CCAR1-212ENST00000540210 3415 ntTSL 1 (best)4.35□□□□□ -1.711e-8■■■■■ 46.5
UTP3Q9NQZ2 KLHL24-203ENST00000437402 563 ntTSL 523.4■■□□□ 1.341e-6■■■■■ 46.5
UTP3Q9NQZ2 KLHL24-213ENST00000482138 588 ntTSL 422.33■■□□□ 1.171e-6■■■■■ 46.5
UTP3Q9NQZ2 KLHL24-215ENST00000493074 627 ntTSL 422.33■■□□□ 1.171e-6■■■■■ 46.5
UTP3Q9NQZ2 KLHL24-204ENST00000454495 603 ntTSL 321.84■■□□□ 1.091e-6■■■■■ 46.5
UTP3Q9NQZ2 KLHL24-202ENST00000427201 562 ntTSL 421.05■□□□□ 0.961e-6■■■■■ 46.5
UTP3Q9NQZ2 KLHL24-209ENST00000473045 542 ntTSL 420.35■□□□□ 0.851e-6■■■■■ 46.5
UTP3Q9NQZ2 KLHL24-208ENST00000468101 574 ntTSL 418.58■□□□□ 0.561e-6■■■■■ 46.5
UTP3Q9NQZ2 MED15-218ENST00000451058 418 ntTSL 320.35■□□□□ 0.853e-6■■■■■ 46.5
UTP3Q9NQZ2 MED15-216ENST00000445189 596 ntTSL 417.26■□□□□ 0.353e-6■■■■■ 46.5
UTP3Q9NQZ2 SETD2-203ENST00000412450 4231 ntTSL 213.18□□□□□ -0.34e-9■■■■■ 46.5
UTP3Q9NQZ2 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.362e-6■■■■■ 46.5
UTP3Q9NQZ2 FLNC-201ENST00000325888 9188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.227e-7■■■■■ 46.5
UTP3Q9NQZ2 FLNC-202ENST00000346177 9042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.137e-7■■■■■ 46.5
UTP3Q9NQZ2 DLGAP4-213ENST00000489701 2396 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.47e-7■■■■■ 46.5
UTP3Q9NQZ2 SLC25A29-203ENST00000553359 797 ntTSL 230.03■■■□□ 2.45e-8■■■■■ 46.5
UTP3Q9NQZ2 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.575e-8■■■■■ 46.5
UTP3Q9NQZ2 SLC25A29-218ENST00000556868 1067 ntTSL 224.83■■□□□ 1.575e-8■■■■■ 46.5
UTP3Q9NQZ2 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.355e-8■■■■■ 46.5
UTP3Q9NQZ2 UBE2Z-205ENST00000508468 573 ntTSL 322.77■■□□□ 1.242e-6■■■■■ 46.5
UTP3Q9NQZ2 LMBR1-217ENST00000485985 644 ntTSL 222.14■■□□□ 1.133e-6■■■■■ 46.5
UTP3Q9NQZ2 SLC25A29-219ENST00000556873 569 ntTSL 421.58■■□□□ 1.055e-8■■■■■ 46.5
UTP3Q9NQZ2 SLC25A29-216ENST00000556715 1025 ntTSL 321.27■■□□□ 15e-8■■■■■ 46.5
UTP3Q9NQZ2 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.992e-6■■■■■ 46.5
UTP3Q9NQZ2 SLC25A29-206ENST00000554224 1124 ntTSL 320.7■□□□□ 0.95e-8■■■■■ 46.5
UTP3Q9NQZ2 SLC25A29-205ENST00000554060 674 ntTSL 220.1■□□□□ 0.815e-8■■■■■ 46.5
UTP3Q9NQZ2 PRPF31-207ENST00000466404 1837 ntTSL 219.83■□□□□ 0.773e-6■■■■■ 46.5
UTP3Q9NQZ2 PRPF31-205ENST00000445811 928 ntTSL 519.46■□□□□ 0.713e-6■■■■■ 46.5
UTP3Q9NQZ2 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.653e-6■■■■■ 46.5
UTP3Q9NQZ2 PRPF31-209ENST00000498612 881 ntTSL 519.1■□□□□ 0.653e-6■■■■■ 46.5
UTP3Q9NQZ2 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.53e-6■■■■■ 46.5
UTP3Q9NQZ2 SLC38A10-206ENST00000540966 896 ntTSL 318■□□□□ 0.475e-8■■■■■ 46.5
UTP3Q9NQZ2 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.413e-6■■■■■ 46.5
UTP3Q9NQZ2 PRPF31-204ENST00000445124 886 ntTSL 517.32■□□□□ 0.363e-6■■■■■ 46.5
UTP3Q9NQZ2 PRPF31-206ENST00000447810 854 ntTSL 517.32■□□□□ 0.363e-6■■■■■ 46.5
UTP3Q9NQZ2 SLC38A10-211ENST00000576151 774 ntTSL 216.52■□□□□ 0.245e-8■■■■■ 46.5
UTP3Q9NQZ2 INTS3-207ENST00000481797 5741 ntTSL 215.41■□□□□ 0.061e-6■■■■■ 46.5
UTP3Q9NQZ2 STK11-209ENST00000593219 637 ntTSL 314.64□□□□□ -0.073e-7■■■■■ 46.5
UTP3Q9NQZ2 INTS3-201ENST00000318967 5235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.391e-6■■■■■ 46.5
UTP3Q9NQZ2 INTS3-202ENST00000368669 2889 ntTSL 212.1□□□□□ -0.471e-6■■■■■ 46.5
UTP3Q9NQZ2 INTS3-210ENST00000512605 3442 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.661e-6■■■■■ 46.5
UTP3Q9NQZ2 INTS3-203ENST00000368670 3047 ntTSL 210.7□□□□□ -0.71e-6■■■■■ 46.5
UTP3Q9NQZ2 DIABLO-209ENST00000474004 804 ntTSL 27.37□□□□□ -1.234e-7■■■■■ 46.5
UTP3Q9NQZ2 INTS3-205ENST00000476843 3404 ntTSL 1 (best)7.14□□□□□ -1.271e-6■■■■■ 46.5
UTP3Q9NQZ2 ABO-201ENST00000453660 6341 ntTSL 1 (best)16.14■□□□□ 0.172e-6■■■■■ 46.5
UTP3Q9NQZ2 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.621e-7■■■■■ 46.5
UTP3Q9NQZ2 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.371e-7■■■■■ 46.5
UTP3Q9NQZ2 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.451e-7■■■■■ 46.5
UTP3Q9NQZ2 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.582e-31■■■■■ 46.4
UTP3Q9NQZ2 THRAP3-203ENST00000469141 3339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.262e-6■■■■■ 46.4
UTP3Q9NQZ2 THRAP3-201ENST00000354618 4432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.342e-6■■■■■ 46.4
UTP3Q9NQZ2 EPB41-210ENST00000482464 675 ntTSL 218.65■□□□□ 0.582e-6■■■■■ 46.4
UTP3Q9NQZ2 ACSL3-209ENST00000535678 560 ntTSL 320.95■□□□□ 0.944e-6■■■■■ 46.4
UTP3Q9NQZ2 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.594e-6■■■■■ 46.4
UTP3Q9NQZ2 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.154e-6■■■■■ 46.4
UTP3Q9NQZ2 TMC6-213ENST00000589933 580 ntTSL 322.27■■□□□ 1.161e-9■■■■■ 46.4
UTP3Q9NQZ2 RSRC2-204ENST00000433877 1956 ntTSL 214.7□□□□□ -0.062e-7■■■■■ 46.4
UTP3Q9NQZ2 RSRC2-220ENST00000532695 2001 ntTSL 212.58□□□□□ -0.42e-7■■■■■ 46.4
UTP3Q9NQZ2 RSRC2-211ENST00000527173 2570 ntTSL 26.7□□□□□ -1.342e-7■■■■■ 46.4
UTP3Q9NQZ2 TRIM56-201ENST00000306085 10952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.263e-6■■■■■ 46.4
UTP3Q9NQZ2 ANP32E-205ENST00000533654 908 ntTSL 2 BASIC9.23□□□□□ -0.934e-7■■■■■ 46.4
UTP3Q9NQZ2 ANP32E-207ENST00000534437 616 ntTSL 37.52□□□□□ -1.214e-7■■■■■ 46.4
UTP3Q9NQZ2 ANP32E-209ENST00000616917 2989 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.864e-7■■■■■ 46.4
UTP3Q9NQZ2 POLD1-204ENST00000593981 873 ntTSL 520.64■□□□□ 0.893e-9■■■■■ 46.3
UTP3Q9NQZ2 POLD1-202ENST00000593407 867 ntTSL 520.54■□□□□ 0.883e-9■■■■■ 46.3
UTP3Q9NQZ2 POLD1-208ENST00000596648 1048 ntTSL 519.87■□□□□ 0.773e-9■■■■■ 46.3
UTP3Q9NQZ2 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.971e-8■■■■■ 46.3
UTP3Q9NQZ2 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.911e-8■■■■■ 46.3
UTP3Q9NQZ2 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.31e-8■■■■■ 46.3
UTP3Q9NQZ2 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.51e-8■■■■■ 46.3
UTP3Q9NQZ2 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 14e-7■■■■■ 46.3
UTP3Q9NQZ2 ZNF217-202ENST00000371471 5796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.492e-7■■■■■ 46.3
UTP3Q9NQZ2 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.181e-6■■■■■ 46.3
UTP3Q9NQZ2 NRDC-202ENST00000354831 3895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.011e-6■■■■■ 46.3
UTP3Q9NQZ2 NRDC-214ENST00000544028 3819 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.021e-6■■■■■ 46.3
UTP3Q9NQZ2 RPS2-211ENST00000531065 1548 ntTSL 529.26■■■□□ 2.274e-7■■■■■ 46.3
UTP3Q9NQZ2 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.144e-7■■■■■ 46.3
Retrieved 100 of 52,753 protein–RNA pairs in 374 ms