Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

Predictions only

Length 1,337 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 CEP85-202ENST00000451429 4061 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PTPRJQ12913 PUM2-204ENST00000403432 3594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PTPRJQ12913 AC099494.1-201ENST00000624763 1370 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
PTPRJQ12913 PRAMEF8-203ENST00000621519 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PTPRJQ12913 EPM2AIP1-201ENST00000322716 8126 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PTPRJQ12913 NBN-203ENST00000409330 4523 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PTPRJQ12913 BMPR1B-208ENST00000515059 5567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PTPRJQ12913 CELSR3-201ENST00000164024 11956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PTPRJQ12913 ADGRG1-266ENST00000568908 3852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PTPRJQ12913 SETD4-201ENST00000332131 3015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PTPRJQ12913 PPME1-201ENST00000328257 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PTPRJQ12913 NUDT7-201ENST00000268533 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PTPRJQ12913 SRP9-202ENST00000366838 540 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PTPRJQ12913 CRABP2-203ENST00000368222 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PTPRJQ12913 RESP18-202ENST00000392083 626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PTPRJQ12913 RPS8-202ENST00000396651 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PTPRJQ12913 STEAP1B-202ENST00000406890 1193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PTPRJQ12913 AL591479.1-201ENST00000417001 635 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
PTPRJQ12913 OR6V1-201ENST00000418316 1028 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PTPRJQ12913 LINC01320-201ENST00000423663 1109 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PTPRJQ12913 AL360181.2-201ENST00000424450 626 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PTPRJQ12913 ATP5G1P4-201ENST00000430660 441 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
PTPRJQ12913 AL359458.1-201ENST00000430821 400 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PTPRJQ12913 AC067945.2-201ENST00000431351 623 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PTPRJQ12913 NREP-208ENST00000453526 559 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PTPRJQ12913 AC005534.1-201ENST00000455709 742 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PTPRJQ12913 AL353807.2-201ENST00000456382 220 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PTPRJQ12913 RN7SL709P-201ENST00000478855 300 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
PTPRJQ12913 RABL3-206ENST00000483733 760 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PTPRJQ12913 SLIT2-204ENST00000504154 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PTPRJQ12913 ASS1P10-201ENST00000507235 1244 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
PTPRJQ12913 MIR3945HG-201ENST00000510284 576 ntTSL 4 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PTPRJQ12913 SNORA31.7-201ENST00000516287 135 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
PTPRJQ12913 AC008464.1-201ENST00000523050 663 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PTPRJQ12913 NUDT7-205ENST00000564085 899 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PTPRJQ12913 CA5AP1-201ENST00000568175 576 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
PTPRJQ12913 RN7SL644P-201ENST00000577919 259 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
PTPRJQ12913 AC015802.4-203ENST00000592622 570 ntTSL 4 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PTPRJQ12913 AC005387.2-201ENST00000596596 440 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PTPRJQ12913 AC006027.1-201ENST00000608195 741 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
PTPRJQ12913 NUDT7-207ENST00000613075 1073 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PTPRJQ12913 SLIRP-212ENST00000613856 420 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PTPRJQ12913 AC022613.2-201ENST00000557989 1451 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
PTPRJQ12913 PCDHGA8-202ENST00000610569 6480 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
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PTPRJQ12913 LHX6-203ENST00000373755 3384 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
PTPRJQ12913 TTLL2-201ENST00000239587 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
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PTPRJQ12913 MIR194-2HG-201ENST00000413053 3647 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
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PTPRJQ12913 C3orf20-201ENST00000253697 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PTPRJQ12913 GRM4-202ENST00000374181 7275 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
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PTPRJQ12913 COL11A1-210ENST00000512756 5442 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
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PTPRJQ12913 AC005324.4-204ENST00000413242 4262 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
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PTPRJQ12913 AP001625.3-201ENST00000416179 449 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
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PTPRJQ12913 KRTAP21-4P-201ENST00000454921 816 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
PTPRJQ12913 ST3GAL5-AS1-201ENST00000455121 783 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
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PTPRJQ12913 RN7SL309P-201ENST00000491364 286 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
PTPRJQ12913 IGKV1-8-201ENST00000495489 398 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PTPRJQ12913 RPSAP71-201ENST00000522496 872 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
PTPRJQ12913 KRTAP2-1-202ENST00000542137 375 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PTPRJQ12913 AL354993.2-201ENST00000558738 542 ntTSL 4 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PTPRJQ12913 TMEM91-214ENST00000604123 757 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PTPRJQ12913 ECSCR-201ENST00000618155 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PTPRJQ12913 AC012065.5-201ENST00000624084 510 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
PTPRJQ12913 AC239585.2-202ENST00000624629 434 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PTPRJQ12913 CEP170-204ENST00000366544 6805 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PTPRJQ12913 RBFOX2-210ENST00000449924 1935 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PTPRJQ12913 TCF4-204ENST00000457482 2372 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PTPRJQ12913 GPR132-201ENST00000329797 3660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PTPRJQ12913 MSS51-202ENST00000372912 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PTPRJQ12913 LIMCH1-210ENST00000509454 1506 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PTPRJQ12913 RAB39B-201ENST00000369454 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PTPRJQ12913 RPH3A-213ENST00000548866 2429 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PTPRJQ12913 ZNF57-203ENST00000523428 1774 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
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