RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000239587.9

TTLL2-201, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TTLL2, Length 2,075 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Exosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL2-201ENST00000239587 NISCHQ9Y2I1 1504 aa23.26■■□□□ 1.31
TTLL2-201ENST00000239587 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa20.09■□□□□ 0.81
TTLL2-201ENST00000239587 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP19.98■□□□□ 0.79
TTLL2-201ENST00000239587 HRCP23327 699 aa19.85■□□□□ 0.77
TTLL2-201ENST00000239587 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa19.78■□□□□ 0.76
TTLL2-201ENST00000239587 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP19.74■□□□□ 0.75
TTLL2-201ENST00000239587 CHIC1Q5VXU3 224 aa19.63■□□□□ 0.73
TTLL2-201ENST00000239587 MYO15BQ96JP2 1530 aa19.56■□□□□ 0.72
TTLL2-201ENST00000239587 PCGF6Q9BYE7 350 aa19.51■□□□□ 0.71
TTLL2-201ENST00000239587 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa19.33■□□□□ 0.69
TTLL2-201ENST00000239587 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP19.24■□□□□ 0.67
TTLL2-201ENST00000239587 DCAF8L2P0C7V8 631 aa19.19■□□□□ 0.66
TTLL2-201ENST00000239587 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP19.11■□□□□ 0.65
TTLL2-201ENST00000239587 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa19.04■□□□□ 0.64
TTLL2-201ENST00000239587 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP19.01■□□□□ 0.63
TTLL2-201ENST00000239587 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP18.97■□□□□ 0.63
TTLL2-201ENST00000239587 ABCC9O60706 1549 aa18.76■□□□□ 0.59
TTLL2-201ENST00000239587 TRIM41Q8WV44 630 aa18.64■□□□□ 0.57
TTLL2-201ENST00000239587 SCRIBQ14160 1630 aa18.57■□□□□ 0.56
TTLL2-201ENST00000239587 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP18.53■□□□□ 0.56
TTLL2-201ENST00000239587 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP18.52■□□□□ 0.56
TTLL2-201ENST00000239587 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa18.44■□□□□ 0.54
TTLL2-201ENST00000239587 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP18.43■□□□□ 0.54
TTLL2-201ENST00000239587 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP18.28■□□□□ 0.52
TTLL2-201ENST00000239587 MYT1Q01538 1121 aa18.24■□□□□ 0.51
TTLL2-201ENST00000239587 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP18.24■□□□□ 0.51
TTLL2-201ENST00000239587 EHMT2Q96KQ7 1210 aa18.22■□□□□ 0.51
TTLL2-201ENST00000239587 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP18.22■□□□□ 0.51
TTLL2-201ENST00000239587 NACADO15069 1562 aa18.16■□□□□ 0.5
TTLL2-201ENST00000239587 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP18.16■□□□□ 0.5
TTLL2-201ENST00000239587 CECR2Q9BXF3 1484 aa18.15■□□□□ 0.5
TTLL2-201ENST00000239587 NEUROD1Q13562 356 aa18.13■□□□□ 0.49
TTLL2-201ENST00000239587 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP18.13■□□□□ 0.49
TTLL2-201ENST00000239587 MROH2BQ7Z745 1585 aa18.12■□□□□ 0.49
TTLL2-201ENST00000239587 WIZO95785 1651 aa18.09■□□□□ 0.49
TTLL2-201ENST00000239587 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa18.06■□□□□ 0.48
TTLL2-201ENST00000239587 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP17.99■□□□□ 0.47
TTLL2-201ENST00000239587 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP17.97■□□□□ 0.47
TTLL2-201ENST00000239587 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP17.96■□□□□ 0.47
TTLL2-201ENST00000239587 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP17.89■□□□□ 0.45
TTLL2-201ENST00000239587 CEP162Q5TB80 1403 aa17.84■□□□□ 0.45
TTLL2-201ENST00000239587 TNIKQ9UKE5 1360 aa17.82■□□□□ 0.44
TTLL2-201ENST00000239587 EEA1Q15075 1411 aa17.79■□□□□ 0.44
TTLL2-201ENST00000239587 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP17.77■□□□□ 0.44
TTLL2-201ENST00000239587 UNC13AQ9UPW8 1703 aa17.76■□□□□ 0.43
TTLL2-201ENST00000239587 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP17.76■□□□□ 0.43
TTLL2-201ENST00000239587 SMARCA4P51532 1647 aa17.74■□□□□ 0.43
TTLL2-201ENST00000239587 CCDC88BA6NC98 1476 aa17.74■□□□□ 0.43
TTLL2-201ENST00000239587 ABCC8Q09428 1581 aa17.74■□□□□ 0.43
TTLL2-201ENST00000239587 CSRNP3Q8WYN3 585 aa17.7■□□□□ 0.42
TTLL2-201ENST00000239587 UBTFP17480 764 aaKnown RBP17.7■□□□□ 0.42
TTLL2-201ENST00000239587 SMARCA2P51531 1590 aa17.69■□□□□ 0.42
TTLL2-201ENST00000239587 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP17.68■□□□□ 0.42
TTLL2-201ENST00000239587 SOGA1O94964 1423 aa17.66■□□□□ 0.42
TTLL2-201ENST00000239587 GOLGA3Q08378 1498 aa17.63■□□□□ 0.41
TTLL2-201ENST00000239587 MIER1Q8N108 512 aa17.61■□□□□ 0.41
TTLL2-201ENST00000239587 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP17.59■□□□□ 0.41
TTLL2-201ENST00000239587 CLSPNQ9HAW4 1339 aa17.54■□□□□ 0.4
TTLL2-201ENST00000239587 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP17.52■□□□□ 0.4
TTLL2-201ENST00000239587 BICRAQ9NZM4 1560 aa17.51■□□□□ 0.39
TTLL2-201ENST00000239587 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa17.51■□□□□ 0.39
TTLL2-201ENST00000239587 APLP2Q06481 763 aa17.51■□□□□ 0.39
TTLL2-201ENST00000239587 CEP164Q9UPV0 1460 aa17.49■□□□□ 0.39
TTLL2-201ENST00000239587 CLIP1P30622 1438 aa17.44■□□□□ 0.38
TTLL2-201ENST00000239587 KIF21BO75037 1637 aa17.43■□□□□ 0.38
TTLL2-201ENST00000239587 VPS8Q8N3P4 1428 aa17.42■□□□□ 0.38
TTLL2-201ENST00000239587 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP17.37■□□□□ 0.37
TTLL2-201ENST00000239587 PEG3Q9GZU2 1588 aa17.35■□□□□ 0.37
TTLL2-201ENST00000239587 SYNJ1O43426 1573 aa17.34■□□□□ 0.37
TTLL2-201ENST00000239587 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP17.28■□□□□ 0.36
TTLL2-201ENST00000239587 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP17.24■□□□□ 0.35
TTLL2-201ENST00000239587 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa17.21■□□□□ 0.35
TTLL2-201ENST00000239587 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa17.17■□□□□ 0.34
TTLL2-201ENST00000239587 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP17.15■□□□□ 0.34
TTLL2-201ENST00000239587 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa17.11■□□□□ 0.33
TTLL2-201ENST00000239587 DNAJC5BQ9UF47 199 aa17.1■□□□□ 0.33
TTLL2-201ENST00000239587 ANP32EQ9BTT0 268 aa17.09■□□□□ 0.33
TTLL2-201ENST00000239587 ERICH3Q5RHP9 1530 aa17.09■□□□□ 0.33
TTLL2-201ENST00000239587 TOP2BQ02880 1626 aa17.08■□□□□ 0.32
TTLL2-201ENST00000239587 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP17.08■□□□□ 0.32
TTLL2-201ENST00000239587 CUX2O14529 1486 aa17.06■□□□□ 0.32
TTLL2-201ENST00000239587 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa17.05■□□□□ 0.32
TTLL2-201ENST00000239587 ARAP1Q96P48 1450 aa17.04■□□□□ 0.32
TTLL2-201ENST00000239587 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP17.02■□□□□ 0.32
TTLL2-201ENST00000239587 PRXQ9BXM0 1461 aa17.01■□□□□ 0.31
TTLL2-201ENST00000239587 CCNB3Q8WWL7 1395 aa17■□□□□ 0.31
TTLL2-201ENST00000239587 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa16.95■□□□□ 0.3
TTLL2-201ENST00000239587 NEFLP07196 543 aa16.92■□□□□ 0.3
TTLL2-201ENST00000239587 FKBP8Q14318 412 aa16.9■□□□□ 0.3
TTLL2-201ENST00000239587 KIF27Q86VH2 1401 aa16.89■□□□□ 0.3
TTLL2-201ENST00000239587 ITGAEP38570 1179 aa16.89■□□□□ 0.29
TTLL2-201ENST00000239587 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa16.88■□□□□ 0.29
TTLL2-201ENST00000239587 CUX1P39880 1505 aa16.87■□□□□ 0.29
TTLL2-201ENST00000239587 KCNH8Q96L42 1107 aa16.86■□□□□ 0.29
TTLL2-201ENST00000239587 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa16.86■□□□□ 0.29
TTLL2-201ENST00000239587 BCANQ96GW7 911 aa16.85■□□□□ 0.29
TTLL2-201ENST00000239587 SETD5Q9C0A6 1442 aa16.85■□□□□ 0.29
TTLL2-201ENST00000239587 HMGXB3Q12766 1538 aa16.85■□□□□ 0.29
TTLL2-201ENST00000239587 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP16.83■□□□□ 0.28
TTLL2-201ENST00000239587 MAPKBP1O60336 1514 aa16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.7 ms