Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQZ2

UTP3, Something about silencing protein 10, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 479 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP3Q9NQZ2 NOSIP-207ENST00000598544 429 ntTSL 310.07□□□□□ -0.83e-8■■■■■ 46.9
UTP3Q9NQZ2 CYTOR-202ENST00000409054 1096 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.382e-6■■■■■ 46.9
UTP3Q9NQZ2 CYTOR-201ENST00000331944 529 ntTSL 1 (best)12.48□□□□□ -0.412e-6■■■■■ 46.9
UTP3Q9NQZ2 CYTOR-209ENST00000423846 457 ntTSL 1 (best)12.13□□□□□ -0.472e-6■■■■■ 46.9
UTP3Q9NQZ2 CYTOR-208ENST00000419680 675 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.552e-6■■■■■ 46.9
UTP3Q9NQZ2 CYTOR-211ENST00000455131 733 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.552e-6■■■■■ 46.9
UTP3Q9NQZ2 CYTOR-207ENST00000414584 772 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.192e-6■■■■■ 46.9
UTP3Q9NQZ2 VARS2-209ENST00000477288 6054 ntTSL 222.58■■□□□ 1.212e-6■■■■■ 46.8
UTP3Q9NQZ2 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.52e-6■■■■■ 46.8
UTP3Q9NQZ2 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.332e-6■■■■■ 46.8
UTP3Q9NQZ2 SSRP1-202ENST00000293880 6296 ntTSL 219.49■□□□□ 0.716e-7■■■■■ 46.8
UTP3Q9NQZ2 SSRP1-201ENST00000278412 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.356e-7■■■■■ 46.8
UTP3Q9NQZ2 GPI-216ENST00000592144 678 ntTSL 319.41■□□□□ 0.71e-6■■■■■ 46.7
UTP3Q9NQZ2 GPI-209ENST00000589399 565 ntTSL 518.68■□□□□ 0.581e-6■■■■■ 46.7
UTP3Q9NQZ2 GPI-211ENST00000589640 571 ntTSL 418.48■□□□□ 0.551e-6■■■■■ 46.7
UTP3Q9NQZ2 GPI-214ENST00000590375 529 ntTSL 418.48■□□□□ 0.551e-6■■■■■ 46.7
UTP3Q9NQZ2 GPI-215ENST00000591204 559 ntTSL 49.69□□□□□ -0.861e-6■■■■■ 46.7
UTP3Q9NQZ2 MYRF-204ENST00000536352 1067 ntTSL 519.03■□□□□ 0.642e-17■■■■■ 46.7
UTP3Q9NQZ2 YOD1-201ENST00000315927 6265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.352e-6■■■■■ 46.7
UTP3Q9NQZ2 YOD1-202ENST00000367084 6291 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.852e-6■■■■■ 46.7
UTP3Q9NQZ2 LMAN2-202ENST00000502560 876 ntTSL 320.01■□□□□ 0.793e-6■■■■■ 46.7
UTP3Q9NQZ2 HMG20B-209ENST00000470356 806 ntTSL 1 (best)33.15■■■□□ 2.91e-6■■■■■ 46.7
UTP3Q9NQZ2 GNL2-202ENST00000462812 2409 ntTSL 29.84□□□□□ -0.831e-7■■■■■ 46.6
UTP3Q9NQZ2 GNL2-201ENST00000373062 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.931e-7■■■■■ 46.6
UTP3Q9NQZ2 ATP2A2-209ENST00000550248 544 ntTSL 48.16□□□□□ -1.13e-6■■■■■ 46.6
UTP3Q9NQZ2 PKM-224ENST00000569857 1355 ntTSL 513.39□□□□□ -0.276e-7■■■■■ 46.6
UTP3Q9NQZ2 APLP2-208ENST00000526330 582 ntTSL 322.2■■□□□ 1.148e-7■■■■■ 46.6
UTP3Q9NQZ2 APLP2-209ENST00000527702 579 ntTSL 422.2■■□□□ 1.148e-7■■■■■ 46.6
UTP3Q9NQZ2 APLP2-213ENST00000529701 573 ntTSL 522.2■■□□□ 1.148e-7■■■■■ 46.6
UTP3Q9NQZ2 APLP2-223ENST00000534001 585 ntTSL 422.2■■□□□ 1.148e-7■■■■■ 46.6
UTP3Q9NQZ2 APLP2-224ENST00000534582 556 ntTSL 522.2■■□□□ 1.148e-7■■■■■ 46.6
UTP3Q9NQZ2 APLP2-225ENST00000534761 551 ntTSL 517.97■□□□□ 0.478e-7■■■■■ 46.6
UTP3Q9NQZ2 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.51e-6■■■■■ 46.6
UTP3Q9NQZ2 TCEA1-209ENST00000521836 625 ntTSL 425.58■■□□□ 1.692e-17■■■■■ 46.6
UTP3Q9NQZ2 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.521e-6■■■■■ 46.6
UTP3Q9NQZ2 DYM-206ENST00000577836 552 ntTSL 523.74■■□□□ 1.391e-6■■■■■ 46.6
UTP3Q9NQZ2 TBC1D25-202ENST00000418627 691 ntTSL 223.66■■□□□ 1.381e-6■■■■■ 46.6
UTP3Q9NQZ2 CREB3L2-206ENST00000468127 596 ntTSL 323.53■■□□□ 1.361e-6■■■■■ 46.6
UTP3Q9NQZ2 DYM-213ENST00000582095 590 ntTSL 523.03■■□□□ 1.281e-6■■■■■ 46.6
UTP3Q9NQZ2 DNAJB9-203ENST00000491582 584 ntTSL 222.48■■□□□ 1.191e-6■■■■■ 46.6
UTP3Q9NQZ2 TBC1D25-205ENST00000494495 540 ntTSL 222.42■■□□□ 1.181e-6■■■■■ 46.6
UTP3Q9NQZ2 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.171e-6■■■■■ 46.6
UTP3Q9NQZ2 ZZZ3-203ENST00000414381 561 ntTSL 422.08■■□□□ 1.135e-12■■■■■ 46.6
UTP3Q9NQZ2 PALM-210ENST00000593172 2489 ntTSL 221.65■■□□□ 1.061e-6■■■■■ 46.6
UTP3Q9NQZ2 TBC1D25-203ENST00000476141 819 ntTSL 1 (best)21.4■■□□□ 1.021e-6■■■■■ 46.6
UTP3Q9NQZ2 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.981e-6■■■■■ 46.6
UTP3Q9NQZ2 PALM-211ENST00000633534 879 ntTSL 321■□□□□ 0.951e-6■■■■■ 46.6
UTP3Q9NQZ2 KISS1R-202ENST00000592648 507 ntTSL 520.45■□□□□ 0.861e-6■■■■■ 46.6
UTP3Q9NQZ2 ZZZ3-206ENST00000463166 587 ntTSL 220.41■□□□□ 0.865e-12■■■■■ 46.6
UTP3Q9NQZ2 B4GALNT4-204ENST00000530717 409 ntTSL 320.14■□□□□ 0.815e-12■■■■■ 46.6
UTP3Q9NQZ2 HSPG2-210ENST00000481644 839 ntTSL 219.97■□□□□ 0.791e-6■■■■■ 46.6
UTP3Q9NQZ2 DYM-204ENST00000577481 567 ntTSL 519.87■□□□□ 0.771e-6■■■■■ 46.6
UTP3Q9NQZ2 DYM-209ENST00000579058 869 ntTSL 319.43■□□□□ 0.71e-6■■■■■ 46.6
UTP3Q9NQZ2 CPSF4-205ENST00000440514 578 ntTSL 319.34■□□□□ 0.691e-6■■■■■ 46.6
UTP3Q9NQZ2 PISD-214ENST00000478893 1056 ntTSL 219.08■□□□□ 0.641e-6■■■■■ 46.6
UTP3Q9NQZ2 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.611e-6■■■■■ 46.6
UTP3Q9NQZ2 SBNO2-203ENST00000586109 465 ntTSL 318.52■□□□□ 0.561e-6■■■■■ 46.6
UTP3Q9NQZ2 ZNF518A-205ENST00000488700 729 ntTSL 218.47■□□□□ 0.551e-6■■■■■ 46.6
UTP3Q9NQZ2 ACAD9-210ENST00000514336 583 ntTSL 318.25■□□□□ 0.511e-6■■■■■ 46.6
UTP3Q9NQZ2 ACAD9-211ENST00000514643 831 ntTSL 318.25■□□□□ 0.511e-6■■■■■ 46.6
UTP3Q9NQZ2 ACAD9-212ENST00000515429 546 ntTSL 418.25■□□□□ 0.511e-6■■■■■ 46.6
UTP3Q9NQZ2 TBC1D25-204ENST00000481090 884 ntTSL 1 (best)18.14■□□□□ 0.491e-6■■■■■ 46.6
UTP3Q9NQZ2 LEMD2-205ENST00000504692 643 ntTSL 318.14■□□□□ 0.491e-6■■■■■ 46.6
UTP3Q9NQZ2 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC18.13■□□□□ 0.491e-6■■■■■ 46.6
UTP3Q9NQZ2 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.441e-6■■■■■ 46.6
UTP3Q9NQZ2 TACC3-204ENST00000466077 583 ntTSL 217.8■□□□□ 0.441e-6■■■■■ 46.6
UTP3Q9NQZ2 DYM-219ENST00000584977 656 ntTSL 317.72■□□□□ 0.431e-6■■■■■ 46.6
UTP3Q9NQZ2 NLRP1-211ENST00000574406 1750 ntTSL 217.61■□□□□ 0.411e-6■■■■■ 46.6
UTP3Q9NQZ2 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.391e-6■■■■■ 46.6
UTP3Q9NQZ2 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.371e-6■■■■■ 46.6
UTP3Q9NQZ2 ZFR-204ENST00000505366 1159 ntTSL 1 (best)17.07■□□□□ 0.321e-6■■■■■ 46.6
UTP3Q9NQZ2 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.321e-6■■■■■ 46.6
UTP3Q9NQZ2 ACAD9-209ENST00000512801 736 ntTSL 317.06■□□□□ 0.321e-6■■■■■ 46.6
UTP3Q9NQZ2 ACAD9-203ENST00000505602 553 ntTSL 417.02■□□□□ 0.321e-6■■■■■ 46.6
UTP3Q9NQZ2 CCNL2-219ENST00000497013 548 ntTSL 216.97■□□□□ 0.311e-6■■■■■ 46.6
UTP3Q9NQZ2 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.31e-6■■■■■ 46.6
UTP3Q9NQZ2 RNPEP-209ENST00000479726 822 ntTSL 516.77■□□□□ 0.281e-6■■■■■ 46.6
UTP3Q9NQZ2 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.261e-6■■■■■ 46.6
UTP3Q9NQZ2 SNIP1-202ENST00000468040 931 ntTSL 516.3■□□□□ 0.21e-6■■■■■ 46.6
UTP3Q9NQZ2 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.161e-6■■■■■ 46.6
UTP3Q9NQZ2 PISD-217ENST00000491342 692 ntTSL 515.98■□□□□ 0.151e-6■■■■■ 46.6
UTP3Q9NQZ2 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.141e-6■■■■■ 46.6
UTP3Q9NQZ2 PISD-205ENST00000429683 609 ntTSL 315.88■□□□□ 0.131e-6■■■■■ 46.6
UTP3Q9NQZ2 PISD-206ENST00000431201 460 ntTSL 415.88■□□□□ 0.131e-6■■■■■ 46.6
UTP3Q9NQZ2 POLD1-207ENST00000596425 563 ntTSL 315.66■□□□□ 0.11e-6■■■■■ 46.6
UTP3Q9NQZ2 NFYC-218ENST00000488635 1481 ntTSL 1 (best)15.6■□□□□ 0.091e-6■■■■■ 46.6
UTP3Q9NQZ2 RBM6-206ENST00000433811 582 ntTSL 315.58■□□□□ 0.081e-6■■■■■ 46.6
UTP3Q9NQZ2 PPP1R21-203ENST00000416913 3208 ntTSL 215.56■□□□□ 0.081e-6■■■■■ 46.6
UTP3Q9NQZ2 OS9-211ENST00000549897 700 ntTSL 215.51■□□□□ 0.071e-6■■■■■ 46.6
UTP3Q9NQZ2 HNRNPM-216ENST00000602219 1809 nt15.38■□□□□ 0.051e-6■■■■■ 46.6
UTP3Q9NQZ2 NDUFS2-203ENST00000465923 1193 ntTSL 315.18■□□□□ 0.021e-6■■■■■ 46.6
UTP3Q9NQZ2 PPP4R3B-203ENST00000611717 5243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.021e-6■■■■■ 46.6
UTP3Q9NQZ2 COLGALT1-202ENST00000593832 2941 ntTSL 215.05■□□□□ -01e-6■■■■■ 46.6
UTP3Q9NQZ2 ARF3-203ENST00000472621 526 ntTSL 515□□□□□ -0.011e-6■■■■■ 46.6
UTP3Q9NQZ2 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC14.82□□□□□ -0.041e-6■■■■■ 46.6
UTP3Q9NQZ2 MPV17-215ENST00000486898 565 ntTSL 414.82□□□□□ -0.041e-6■■■■■ 46.6
UTP3Q9NQZ2 PISD-210ENST00000442379 722 ntTSL 214.79□□□□□ -0.041e-6■■■■■ 46.6
UTP3Q9NQZ2 PEX13-203ENST00000414712 1014 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.051e-6■■■■■ 46.6
UTP3Q9NQZ2 PPP4R3B-205ENST00000616288 4310 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.081e-6■■■■■ 46.6
UTP3Q9NQZ2 PPP4R3B-206ENST00000616407 4385 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.081e-6■■■■■ 46.6
Retrieved 100 of 52,753 protein–RNA pairs in 391.2 ms