Protein–RNA interactions for Protein: O75533

SF3B1, Splicing factor 3B subunit 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B1O75533 ENY2-206ENST00000518584 566 ntTSL 215.34■□□□□ 0.057e-6■■■■■ 28.7
SF3B1O75533 ENY2-213ENST00000522632 587 ntTSL 215.32■□□□□ 0.047e-6■■■■■ 28.7
SF3B1O75533 CPSF7-207ENST00000449811 567 ntTSL 415.26■□□□□ 0.037e-6■■■■■ 28.7
SF3B1O75533 FUBP1-212ENST00000492405 668 ntTSL 315.19■□□□□ 0.027e-6■■■■■ 28.7
SF3B1O75533 FUBP1-213ENST00000492724 583 ntTSL 315.19■□□□□ 0.027e-6■■■■■ 28.7
SF3B1O75533 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -07e-6■■■■■ 28.7
SF3B1O75533 MTRR-223ENST00000513439 2441 ntTSL 1 (best)14.85□□□□□ -0.037e-6■■■■■ 28.7
SF3B1O75533 LUC7L3-214ENST00000508482 1597 ntTSL 214.85□□□□□ -0.037e-6■■■■■ 28.7
SF3B1O75533 ACTR6-213ENST00000553038 2045 ntTSL 1 (best)14.72□□□□□ -0.057e-6■■■■■ 28.7
SF3B1O75533 MRPS36-204ENST00000512880 1200 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.057e-6■■■■■ 28.7
SF3B1O75533 MIR3940-201ENST00000579148 102 ntBASIC14.71□□□□□ -0.057e-6■■■■■ 28.7
SF3B1O75533 MRPS36-205ENST00000602380 1200 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.057e-6■■■■■ 28.7
SF3B1O75533 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.067e-6■■■■■ 28.7
SF3B1O75533 LUC7L3-207ENST00000505619 658 ntTSL 314.62□□□□□ -0.077e-6■■■■■ 28.7
SF3B1O75533 ZFYVE27-202ENST00000357540 2765 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.097e-6■■■■■ 28.7
SF3B1O75533 ZFYVE27-204ENST00000370610 2769 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.097e-6■■■■■ 28.7
SF3B1O75533 BIRC2-208ENST00000532672 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.117e-6■■■■■ 28.7
SF3B1O75533 SNRNP27-201ENST00000244227 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.137e-6■■■■■ 28.7
SF3B1O75533 SNRNP27-203ENST00000450162 766 ntTSL 214.2□□□□□ -0.147e-6■■■■■ 28.7
SF3B1O75533 PLOD1-206ENST00000470133 362 ntTSL 314.05□□□□□ -0.167e-6■■■■■ 28.7
SF3B1O75533 GAK-216ENST00000511345 3567 ntTSL 213.8□□□□□ -0.27e-6■■■■■ 28.7
SF3B1O75533 ZFYVE27-205ENST00000370613 2669 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.217e-6■■■■■ 28.7
SF3B1O75533 LCOR-203ENST00000371097 4852 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.217e-6■■■■■ 28.7
SF3B1O75533 ENY2-203ENST00000517350 2150 ntTSL 1 (best)13.71□□□□□ -0.227e-6■■■■■ 28.7
SF3B1O75533 MTRR-204ENST00000502550 567 ntTSL 413.55□□□□□ -0.247e-6■■■■■ 28.7
SF3B1O75533 CPSF7-223ENST00000544669 1800 ntTSL 513.51□□□□□ -0.257e-6■■■■■ 28.7
SF3B1O75533 ZFYVE27-201ENST00000337540 2927 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.257e-6■■■■■ 28.7
SF3B1O75533 FGFR1OP-205ENST00000494781 460 ntTSL 313.39□□□□□ -0.277e-6■■■■■ 28.7
SF3B1O75533 ATF6B-211ENST00000453203 425 ntTSL 513.35□□□□□ -0.277e-6■■■■■ 28.7
SF3B1O75533 ANAPC7-203ENST00000455511 3045 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.287e-6■■■■■ 28.7
SF3B1O75533 AC010522.1-206ENST00000604231 576 ntTSL 413.28□□□□□ -0.287e-6■■■■■ 28.7
SF3B1O75533 SUN1-224ENST00000463848 659 ntTSL 413.17□□□□□ -0.37e-6■■■■■ 28.7
SF3B1O75533 ENY2-204ENST00000517756 445 ntTSL 513.13□□□□□ -0.317e-6■■■■■ 28.7
SF3B1O75533 RBM5-207ENST00000438369 560 ntTSL 413.09□□□□□ -0.317e-6■■■■■ 28.7
SF3B1O75533 CPSF7-211ENST00000477890 1234 ntTSL 513□□□□□ -0.337e-6■■■■■ 28.7
SF3B1O75533 G2E3-202ENST00000438909 2334 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.331e-6■■■■■ 28.7
SF3B1O75533 FGFR1OP-207ENST00000622353 3451 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.347e-6■■■■■ 28.7
SF3B1O75533 CIZ1-219ENST00000485001 596 ntTSL 312.88□□□□□ -0.357e-6■■■■■ 28.7
SF3B1O75533 PDCD4-210ENST00000492932 813 ntTSL 312.84□□□□□ -0.357e-6■■■■■ 28.7
SF3B1O75533 ELOC-210ENST00000622804 1976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.47e-6■■■■■ 28.7
SF3B1O75533 CPSF7-218ENST00000537641 1728 ntTSL 512.55□□□□□ -0.47e-6■■■■■ 28.7
SF3B1O75533 RBM5-203ENST00000404526 580 ntTSL 312.5□□□□□ -0.417e-6■■■■■ 28.7
SF3B1O75533 BIRC2-213ENST00000613397 4066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.427e-6■■■■■ 28.7
SF3B1O75533 ZFYVE27-207ENST00000423811 3045 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.467e-6■■■■■ 28.7
SF3B1O75533 ENY2-210ENST00000521662 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.477e-6■■■■■ 28.7
SF3B1O75533 ENY2-214ENST00000522766 567 ntTSL 412.12□□□□□ -0.477e-6■■■■■ 28.7
SF3B1O75533 ZFYVE27-206ENST00000393677 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.487e-6■■■■■ 28.7
SF3B1O75533 DDB1-222ENST00000543627 540 ntTSL 512.03□□□□□ -0.487e-6■■■■■ 28.7
SF3B1O75533 PDCD4-202ENST00000393104 3697 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.517e-6■■■■■ 28.7
SF3B1O75533 ZFYVE27-203ENST00000359980 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.517e-6■■■■■ 28.7
SF3B1O75533 ANAPC7-201ENST00000450008 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.547e-6■■■■■ 28.7
SF3B1O75533 BIRC2-204ENST00000527910 4073 ntTSL 1 (best)11.58□□□□□ -0.567e-6■■■■■ 28.7
SF3B1O75533 ELOC-208ENST00000523815 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.567e-6■■■■■ 28.7
SF3B1O75533 ENY2-207ENST00000519754 561 ntTSL 411.51□□□□□ -0.577e-6■■■■■ 28.7
SF3B1O75533 MTRR-203ENST00000502509 711 ntTSL 311.36□□□□□ -0.597e-6■■■■■ 28.7
SF3B1O75533 BIRC2-202ENST00000527465 595 ntTSL 411.35□□□□□ -0.597e-6■■■■■ 28.7
SF3B1O75533 BIRC2-201ENST00000227758 3743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.67e-6■■■■■ 28.7
SF3B1O75533 CIZ1-213ENST00000471839 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 211.24□□□□□ -0.617e-6■■■■■ 28.7
SF3B1O75533 PRKAA1-208ENST00000511248 668 ntTSL 211.16□□□□□ -0.627e-6■■■■■ 28.7
SF3B1O75533 LRIF1-201ENST00000369763 3475 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.637e-6■■■■■ 28.7
SF3B1O75533 CPSF7-221ENST00000543545 495 ntTSL 510.92□□□□□ -0.667e-6■■■■■ 28.7
SF3B1O75533 PLOD1-209ENST00000491536 639 ntTSL 310.84□□□□□ -0.677e-6■■■■■ 28.7
SF3B1O75533 MTMR3-211ENST00000492087 562 ntTSL 210.83□□□□□ -0.687e-6■■■■■ 28.7
SF3B1O75533 CPSF7-217ENST00000537162 801 ntTSL 310.66□□□□□ -0.77e-6■■■■■ 28.7
SF3B1O75533 ENY2-208ENST00000520147 857 ntTSL 4 BASIC10.59□□□□□ -0.717e-6■■■■■ 28.7
SF3B1O75533 DDB1-206ENST00000535283 1220 ntTSL 210.35□□□□□ -0.757e-6■■■■■ 28.7
SF3B1O75533 ENY2-201ENST00000339942 546 ntTSL 410.34□□□□□ -0.757e-6■■■■■ 28.7
SF3B1O75533 MTRR-221ENST00000512217 520 ntTSL 410.18□□□□□ -0.787e-6■■■■■ 28.7
SF3B1O75533 RBM5-208ENST00000441305 569 ntTSL 310.11□□□□□ -0.797e-6■■■■■ 28.7
SF3B1O75533 ENY2-202ENST00000517311 2966 ntTSL 210.08□□□□□ -0.87e-6■■■■■ 28.7
SF3B1O75533 FAM13A-221ENST00000515155 576 ntTSL 49.95□□□□□ -0.827e-6■■■■■ 28.7
SF3B1O75533 LCOR-209ENST00000540664 2213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.827e-6■■■■■ 28.7
SF3B1O75533 PRKAA1-203ENST00000397006 425 ntTSL 39.82□□□□□ -0.847e-6■■■■■ 28.7
SF3B1O75533 MARK4-204ENST00000588533 625 ntTSL 29.76□□□□□ -0.857e-6■■■■■ 28.7
SF3B1O75533 MTRR-211ENST00000508047 535 ntTSL 49.53□□□□□ -0.887e-6■■■■■ 28.7
SF3B1O75533 MTRF1-204ENST00000430347 557 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.897e-6■■■■■ 28.7
SF3B1O75533 PDCD4-201ENST00000280154 3602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.917e-6■■■■■ 28.7
SF3B1O75533 MTRR-201ENST00000264668 3274 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.927e-6■■■■■ 28.7
SF3B1O75533 CIZ1-210ENST00000461765 677 ntTSL 39.25□□□□□ -0.937e-6■■■■■ 28.7
SF3B1O75533 ACTR6-201ENST00000188312 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.937e-6■■■■■ 28.7
SF3B1O75533 PRPF8-213ENST00000576407 566 ntTSL 29.15□□□□□ -0.947e-6■■■■■ 28.7
SF3B1O75533 PRKAA1-206ENST00000506652 1082 ntTSL 59.05□□□□□ -0.967e-6■■■■■ 28.7
SF3B1O75533 ENY2-211ENST00000521688 2922 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.967e-6■■■■■ 28.7
SF3B1O75533 RAD54L-209ENST00000487700 472 ntTSL 38.86□□□□□ -0.997e-6■■■■■ 28.7
SF3B1O75533 CPSF7-206ENST00000448745 1749 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.017e-6■■■■■ 28.7
SF3B1O75533 RBM5-205ENST00000433556 567 ntTSL 48.67□□□□□ -1.027e-6■■■■■ 28.7
SF3B1O75533 FAM13A-216ENST00000511573 3442 ntTSL 28.64□□□□□ -1.037e-6■■■■■ 28.7
SF3B1O75533 MTRF1-203ENST00000379480 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.037e-6■■■■■ 28.7
SF3B1O75533 CIZ1-212ENST00000471773 717 ntTSL 28.51□□□□□ -1.057e-6■■■■■ 28.7
SF3B1O75533 MARS-231ENST00000553123 724 ntTSL 28.51□□□□□ -1.057e-6■■■■■ 28.7
SF3B1O75533 SLC3A2-219ENST00000542793 539 ntTSL 28.5□□□□□ -1.052e-10■■■■■ 28.7
SF3B1O75533 MTRF1-202ENST00000379477 1948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.45□□□□□ -1.067e-6■■■■■ 28.7
SF3B1O75533 CPSF7-214ENST00000535222 940 ntTSL 38.44□□□□□ -1.067e-6■■■■■ 28.7
SF3B1O75533 ACTR6-209ENST00000551617 1715 ntTSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.067e-6■■■■■ 28.7
SF3B1O75533 ACTR6-202ENST00000546902 1877 ntTSL 2 BASIC8.41□□□□□ -1.067e-6■■■■■ 28.7
SF3B1O75533 ACTR6-203ENST00000547458 595 ntTSL 48.39□□□□□ -1.077e-6■■■■■ 28.7
SF3B1O75533 DYNC1H1-206ENST00000555204 353 ntTSL 38.34□□□□□ -1.077e-6■■■■■ 28.7
SF3B1O75533 BIRC2-205ENST00000528344 866 ntTSL 58.26□□□□□ -1.097e-6■■■■■ 28.7
SF3B1O75533 AC092757.2-201ENST00000559026 633 ntTSL 4 BASIC8.24□□□□□ -1.097e-6■■■■■ 28.7
SF3B1O75533 ACTR6-210ENST00000551652 582 ntTSL 38.22□□□□□ -1.097e-6■■■■■ 28.7
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