Protein–RNA interactions for Protein: O75533

SF3B1, Splicing factor 3B subunit 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B1O75533 RPL13-201ENST00000311528 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.443e-6■■■■■ 28.9
SF3B1O75533 CEP295-206ENST00000531700 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.521e-6■■■■■ 28.9
SF3B1O75533 CEP295-203ENST00000530425 1735 ntAPPRIS ALT2 TSL 42.82□□□□□ -1.961e-6■■■■■ 28.9
SF3B1O75533 UCKL1-207ENST00000632800 1530 ntTSL 515.26■□□□□ 0.037e-7■■■■■ 28.9
SF3B1O75533 ALDOA-210ENST00000563987 586 ntTSL 211.89□□□□□ -0.516e-8■■■■■ 28.8
SF3B1O75533 ALDOA-205ENST00000562168 666 ntTSL 311.01□□□□□ -0.656e-8■■■■■ 28.8
SF3B1O75533 COPB1-209ENST00000533096 547 ntTSL 414.45□□□□□ -0.18e-14■■■■■ 28.8
SF3B1O75533 COPB1-206ENST00000529210 607 ntTSL 413.24□□□□□ -0.298e-14■■■■■ 28.8
SF3B1O75533 COPB1-207ENST00000529866 729 ntTSL 211.64□□□□□ -0.558e-14■■■■■ 28.8
SF3B1O75533 COPB1-211ENST00000534234 1584 ntTSL 59.8□□□□□ -0.848e-14■■■■■ 28.8
SF3B1O75533 COPB1-210ENST00000533533 537 ntTSL 49.57□□□□□ -0.888e-14■■■■■ 28.8
SF3B1O75533 COPB1-212ENST00000534771 576 ntTSL 40.07□□□□□ -2.48e-14■■■■■ 28.8
SF3B1O75533 SMG1P3-202ENST00000437413 589 ntTSL 423.76■■□□□ 1.392e-6■■■■■ 28.8
SF3B1O75533 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.262e-6■■■■■ 28.8
SF3B1O75533 EIF4A2-204ENST00000429589 1005 ntTSL 56.82□□□□□ -1.324e-7■■■■■ 28.8
SF3B1O75533 ZNF292-209ENST00000524067 802 ntTSL 53.84□□□□□ -1.793e-6■■■■■ 28.7
SF3B1O75533 ZNF292-206ENST00000485016 596 ntTSL 33.82□□□□□ -1.83e-6■■■■■ 28.7
SF3B1O75533 PDCD4-205ENST00000467574 735 ntTSL 328.24■■■□□ 2.117e-6■■■■■ 28.7
SF3B1O75533 PDCD4-208ENST00000483670 774 ntTSL 528.15■■■□□ 2.17e-6■■■■■ 28.7
SF3B1O75533 MARK4-209ENST00000592762 683 ntTSL 527.17■■□□□ 1.947e-6■■■■■ 28.7
SF3B1O75533 DPP7-211ENST00000485456 968 ntTSL 526.43■■□□□ 1.827e-6■■■■■ 28.7
SF3B1O75533 DPP7-205ENST00000472306 919 ntTSL 524.8■■□□□ 1.567e-6■■■■■ 28.7
SF3B1O75533 MARS-205ENST00000546481 561 ntTSL 324.67■■□□□ 1.547e-6■■■■■ 28.7
SF3B1O75533 CPSF7-208ENST00000450000 574 ntTSL 424.15■■□□□ 1.467e-6■■■■■ 28.7
SF3B1O75533 DPP7-210ENST00000483783 958 ntTSL 223.96■■□□□ 1.437e-6■■■■■ 28.7
SF3B1O75533 BIRC2-210ENST00000533742 720 ntTSL 223.64■■□□□ 1.387e-6■■■■■ 28.7
SF3B1O75533 LARP4B-205ENST00000448368 1438 ntTSL 423.41■■□□□ 1.347e-6■■■■■ 28.7
SF3B1O75533 MARS-226ENST00000551892 748 ntTSL 323.12■■□□□ 1.297e-6■■■■■ 28.7
SF3B1O75533 MARS-227ENST00000552007 434 ntTSL 323.12■■□□□ 1.297e-6■■■■■ 28.7
SF3B1O75533 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.247e-6■■■■■ 28.7
SF3B1O75533 MARS-207ENST00000547062 571 ntTSL 222.64■■□□□ 1.227e-6■■■■■ 28.7
SF3B1O75533 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.217e-6■■■■■ 28.7
SF3B1O75533 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.197e-6■■■■■ 28.7
SF3B1O75533 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.197e-6■■■■■ 28.7
SF3B1O75533 DDB1-220ENST00000542337 558 ntTSL 322.27■■□□□ 1.167e-6■■■■■ 28.7
SF3B1O75533 RXRB-204ENST00000483281 1977 ntTSL 522.16■■□□□ 1.147e-6■■■■■ 28.7
SF3B1O75533 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.08■■□□□ 1.127e-6■■■■■ 28.7
SF3B1O75533 MARS-232ENST00000553162 575 ntTSL 221.99■■□□□ 1.117e-6■■■■■ 28.7
SF3B1O75533 BIRC2-209ENST00000532832 505 ntTSL 221.95■■□□□ 1.17e-6■■■■■ 28.7
SF3B1O75533 CCNB2-202ENST00000559301 575 ntTSL 221.93■■□□□ 1.17e-6■■■■■ 28.7
SF3B1O75533 MARK4-208ENST00000592207 789 ntTSL 321.78■■□□□ 1.087e-6■■■■■ 28.7
SF3B1O75533 SUN1-223ENST00000459810 569 ntTSL 421.73■■□□□ 1.077e-6■■■■■ 28.7
SF3B1O75533 MARK4-205ENST00000588621 2024 ntTSL 221.42■■□□□ 1.027e-6■■■■■ 28.7
SF3B1O75533 MARS-214ENST00000548714 567 ntTSL 221.22■□□□□ 0.997e-6■■■■■ 28.7
SF3B1O75533 CPSF7-204ENST00000413232 727 ntTSL 321.17■□□□□ 0.987e-6■■■■■ 28.7
SF3B1O75533 MARS-208ENST00000547501 510 ntTSL 221.04■□□□□ 0.967e-6■■■■■ 28.7
SF3B1O75533 MARS-217ENST00000549074 532 ntTSL 421.04■□□□□ 0.967e-6■■■■■ 28.7
SF3B1O75533 MARS-223ENST00000551431 559 ntTSL 421.04■□□□□ 0.967e-6■■■■■ 28.7
SF3B1O75533 MARS-225ENST00000551842 662 ntTSL 221.04■□□□□ 0.967e-6■■■■■ 28.7
SF3B1O75533 ZYX-205ENST00000446634 926 ntTSL 520.83■□□□□ 0.937e-6■■■■■ 28.7
SF3B1O75533 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.97e-6■■■■■ 28.7
SF3B1O75533 MRPS36-202ENST00000503793 288 ntTSL 220.54■□□□□ 0.887e-6■■■■■ 28.7
SF3B1O75533 AC010522.1-201ENST00000597134 540 ntTSL 320.1■□□□□ 0.817e-6■■■■■ 28.7
SF3B1O75533 ZYX-204ENST00000436448 632 ntTSL 419.81■□□□□ 0.767e-6■■■■■ 28.7
SF3B1O75533 MTHFD1L-206ENST00000423867 524 ntTSL 219.73■□□□□ 0.757e-6■■■■■ 28.7
SF3B1O75533 MARS-221ENST00000550449 739 ntTSL 319.72■□□□□ 0.757e-6■■■■■ 28.7
SF3B1O75533 EXOC3-208ENST00000511015 1031 ntTSL 219.41■□□□□ 0.77e-6■■■■■ 28.7
SF3B1O75533 RXRB-203ENST00000481441 1330 ntTSL 219.31■□□□□ 0.687e-6■■■■■ 28.7
SF3B1O75533 PDCD4-203ENST00000444997 819 ntTSL 319.11■□□□□ 0.657e-6■■■■■ 28.7
SF3B1O75533 AC010522.1-202ENST00000593873 556 ntTSL 419.04■□□□□ 0.647e-6■■■■■ 28.7
SF3B1O75533 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.647e-6■■■■■ 28.7
SF3B1O75533 AC010522.1-204ENST00000603271 580 ntTSL 219.04■□□□□ 0.647e-6■■■■■ 28.7
SF3B1O75533 ENY2-215ENST00000523335 1540 ntTSL 219.04■□□□□ 0.647e-6■■■■■ 28.7
SF3B1O75533 RBBP7-209ENST00000468092 630 ntTSL 518.9■□□□□ 0.627e-6■■■■■ 28.7
SF3B1O75533 DPP7-206ENST00000473532 1144 ntTSL 518.8■□□□□ 0.67e-6■■■■■ 28.7
SF3B1O75533 SUN1-231ENST00000480475 680 ntTSL 418.74■□□□□ 0.597e-6■■■■■ 28.7
SF3B1O75533 SUN1-233ENST00000488628 626 ntTSL 418.74■□□□□ 0.597e-6■■■■■ 28.7
SF3B1O75533 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.577e-6■■■■■ 28.7
SF3B1O75533 CPSF7-225ENST00000545934 565 ntTSL 418.49■□□□□ 0.557e-6■■■■■ 28.7
SF3B1O75533 LIG1-204ENST00000542460 1527 ntTSL 218.43■□□□□ 0.543e-6■■■■■ 28.7
SF3B1O75533 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.527e-6■■■■■ 28.7
SF3B1O75533 BIRC2-207ENST00000531259 572 ntTSL 518.19■□□□□ 0.57e-6■■■■■ 28.7
SF3B1O75533 IST1-218ENST00000541180 635 ntTSL 1 (best)18.19■□□□□ 0.57e-6■■■■■ 28.7
SF3B1O75533 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.487e-6■■■■■ 28.7
SF3B1O75533 ENY2-212ENST00000522407 541 ntTSL 417.67■□□□□ 0.427e-6■■■■■ 28.7
SF3B1O75533 CIZ1-220ENST00000485862 843 ntTSL 217.56■□□□□ 0.47e-6■■■■■ 28.7
SF3B1O75533 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.397e-6■■■■■ 28.7
SF3B1O75533 AC010522.1-203ENST00000596498 769 ntTSL 317.4■□□□□ 0.387e-6■■■■■ 28.7
SF3B1O75533 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.367e-6■■■■■ 28.7
SF3B1O75533 YIPF2-211ENST00000592505 530 ntTSL 317.19■□□□□ 0.347e-6■■■■■ 28.7
SF3B1O75533 SUN1-225ENST00000464442 580 ntTSL 417.07■□□□□ 0.327e-6■■■■■ 28.7
SF3B1O75533 MARS-213ENST00000548674 749 ntTSL 517.02■□□□□ 0.327e-6■■■■■ 28.7
SF3B1O75533 MTRR-217ENST00000510279 546 ntTSL 217■□□□□ 0.317e-6■■■■■ 28.7
SF3B1O75533 RAD54L-206ENST00000472889 767 ntTSL 416.57■□□□□ 0.247e-6■■■■■ 28.7
SF3B1O75533 CAPN1-219ENST00000530495 572 ntTSL 516.53■□□□□ 0.247e-6■■■■■ 28.7
SF3B1O75533 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.237e-6■■■■■ 28.7
SF3B1O75533 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.27e-6■■■■■ 28.7
SF3B1O75533 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.187e-6■■■■■ 28.7
SF3B1O75533 MTRR-224ENST00000514220 478 ntTSL 316.15■□□□□ 0.187e-6■■■■■ 28.7
SF3B1O75533 LUC7L3-212ENST00000508045 1112 ntTSL 1 (best)16.07■□□□□ 0.167e-6■■■■■ 28.7
SF3B1O75533 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.137e-6■■■■■ 28.7
SF3B1O75533 DPP7-203ENST00000463619 775 ntTSL 315.8■□□□□ 0.127e-6■■■■■ 28.7
SF3B1O75533 RCC2-203ENST00000474892 783 ntTSL 315.76■□□□□ 0.117e-6■■■■■ 28.7
SF3B1O75533 RBBP7-212ENST00000493145 212 ntTSL 315.67■□□□□ 0.17e-6■■■■■ 28.7
SF3B1O75533 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.097e-6■■■■■ 28.7
SF3B1O75533 LUC7L3-206ENST00000504563 840 ntTSL 515.6■□□□□ 0.097e-6■■■■■ 28.7
SF3B1O75533 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.087e-6■■■■■ 28.7
SF3B1O75533 SUGP2-212ENST00000598863 551 ntTSL 315.51■□□□□ 0.077e-6■■■■■ 28.7
SF3B1O75533 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.077e-6■■■■■ 28.7
SF3B1O75533 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.067e-6■■■■■ 28.7
Retrieved 100 of 46,956 protein–RNA pairs in 835 ms