Protein–RNA interactions for Protein: V9GYQ6

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 96 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
V9GYQ6 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
V9GYQ6 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
V9GYQ6 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
V9GYQ6 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
V9GYQ6 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
V9GYQ6 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
V9GYQ6 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
V9GYQ6 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
V9GYQ6 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
V9GYQ6 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
V9GYQ6 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
V9GYQ6 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
V9GYQ6 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
V9GYQ6 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
V9GYQ6 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
V9GYQ6 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
V9GYQ6 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
V9GYQ6 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
V9GYQ6 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
V9GYQ6 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
V9GYQ6 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
V9GYQ6 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
V9GYQ6 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
V9GYQ6 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
V9GYQ6 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
V9GYQ6 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
V9GYQ6 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
V9GYQ6 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
V9GYQ6 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
V9GYQ6 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
V9GYQ6 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
V9GYQ6 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
V9GYQ6 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
V9GYQ6 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
V9GYQ6 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
V9GYQ6 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
V9GYQ6 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
V9GYQ6 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
V9GYQ6 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
V9GYQ6 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
V9GYQ6 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
V9GYQ6 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
V9GYQ6 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
V9GYQ6 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
V9GYQ6 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
V9GYQ6 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
V9GYQ6 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
V9GYQ6 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
V9GYQ6 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
V9GYQ6 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
V9GYQ6 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
V9GYQ6 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
V9GYQ6 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
V9GYQ6 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
V9GYQ6 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
V9GYQ6 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
V9GYQ6 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
V9GYQ6 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
V9GYQ6 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
V9GYQ6 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
V9GYQ6 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
V9GYQ6 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
V9GYQ6 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
V9GYQ6 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
V9GYQ6 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
V9GYQ6 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
V9GYQ6 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
V9GYQ6 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
V9GYQ6 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
V9GYQ6 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
V9GYQ6 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
V9GYQ6 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
V9GYQ6 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
V9GYQ6 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
V9GYQ6 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
V9GYQ6 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
V9GYQ6 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
V9GYQ6 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
V9GYQ6 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
V9GYQ6 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
V9GYQ6 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
V9GYQ6 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
V9GYQ6 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
V9GYQ6 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
V9GYQ6 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
V9GYQ6 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
V9GYQ6 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
V9GYQ6 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
V9GYQ6 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
V9GYQ6 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
V9GYQ6 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
V9GYQ6 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
V9GYQ6 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
V9GYQ6 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
V9GYQ6 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
V9GYQ6 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
V9GYQ6 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
V9GYQ6 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
V9GYQ6 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
V9GYQ6 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms