Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5R8

TRAPPC1, Trafficking protein particle complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC1Q9Y5R8 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRAPPC1Q9Y5R8 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRAPPC1Q9Y5R8 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRAPPC1Q9Y5R8 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRAPPC1Q9Y5R8 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRAPPC1Q9Y5R8 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRAPPC1Q9Y5R8 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRAPPC1Q9Y5R8 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRAPPC1Q9Y5R8 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRAPPC1Q9Y5R8 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRAPPC1Q9Y5R8 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRAPPC1Q9Y5R8 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRAPPC1Q9Y5R8 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRAPPC1Q9Y5R8 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRAPPC1Q9Y5R8 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRAPPC1Q9Y5R8 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRAPPC1Q9Y5R8 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRAPPC1Q9Y5R8 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRAPPC1Q9Y5R8 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRAPPC1Q9Y5R8 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TRAPPC1Q9Y5R8 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRAPPC1Q9Y5R8 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TRAPPC1Q9Y5R8 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRAPPC1Q9Y5R8 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRAPPC1Q9Y5R8 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRAPPC1Q9Y5R8 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRAPPC1Q9Y5R8 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRAPPC1Q9Y5R8 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRAPPC1Q9Y5R8 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRAPPC1Q9Y5R8 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRAPPC1Q9Y5R8 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRAPPC1Q9Y5R8 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRAPPC1Q9Y5R8 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRAPPC1Q9Y5R8 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRAPPC1Q9Y5R8 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAPPC1Q9Y5R8 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAPPC1Q9Y5R8 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAPPC1Q9Y5R8 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAPPC1Q9Y5R8 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAPPC1Q9Y5R8 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAPPC1Q9Y5R8 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAPPC1Q9Y5R8 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAPPC1Q9Y5R8 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAPPC1Q9Y5R8 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAPPC1Q9Y5R8 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAPPC1Q9Y5R8 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAPPC1Q9Y5R8 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAPPC1Q9Y5R8 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAPPC1Q9Y5R8 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAPPC1Q9Y5R8 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAPPC1Q9Y5R8 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAPPC1Q9Y5R8 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAPPC1Q9Y5R8 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAPPC1Q9Y5R8 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TRAPPC1Q9Y5R8 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TRAPPC1Q9Y5R8 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TRAPPC1Q9Y5R8 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
TRAPPC1Q9Y5R8 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
TRAPPC1Q9Y5R8 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TRAPPC1Q9Y5R8 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TRAPPC1Q9Y5R8 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TRAPPC1Q9Y5R8 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAPPC1Q9Y5R8 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAPPC1Q9Y5R8 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAPPC1Q9Y5R8 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAPPC1Q9Y5R8 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAPPC1Q9Y5R8 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAPPC1Q9Y5R8 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAPPC1Q9Y5R8 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAPPC1Q9Y5R8 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAPPC1Q9Y5R8 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAPPC1Q9Y5R8 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAPPC1Q9Y5R8 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAPPC1Q9Y5R8 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAPPC1Q9Y5R8 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAPPC1Q9Y5R8 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAPPC1Q9Y5R8 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAPPC1Q9Y5R8 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAPPC1Q9Y5R8 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAPPC1Q9Y5R8 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAPPC1Q9Y5R8 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAPPC1Q9Y5R8 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAPPC1Q9Y5R8 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAPPC1Q9Y5R8 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAPPC1Q9Y5R8 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAPPC1Q9Y5R8 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAPPC1Q9Y5R8 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAPPC1Q9Y5R8 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAPPC1Q9Y5R8 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAPPC1Q9Y5R8 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAPPC1Q9Y5R8 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAPPC1Q9Y5R8 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAPPC1Q9Y5R8 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAPPC1Q9Y5R8 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAPPC1Q9Y5R8 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAPPC1Q9Y5R8 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAPPC1Q9Y5R8 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAPPC1Q9Y5R8 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAPPC1Q9Y5R8 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAPPC1Q9Y5R8 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms