Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL42

PNMA2, Paraneoplastic antigen Ma2, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA2Q9UL42 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PNMA2Q9UL42 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PNMA2Q9UL42 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PNMA2Q9UL42 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PNMA2Q9UL42 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PNMA2Q9UL42 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PNMA2Q9UL42 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PNMA2Q9UL42 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PNMA2Q9UL42 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PNMA2Q9UL42 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PNMA2Q9UL42 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PNMA2Q9UL42 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
PNMA2Q9UL42 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PNMA2Q9UL42 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PNMA2Q9UL42 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PNMA2Q9UL42 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PNMA2Q9UL42 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PNMA2Q9UL42 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PNMA2Q9UL42 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PNMA2Q9UL42 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PNMA2Q9UL42 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
PNMA2Q9UL42 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PNMA2Q9UL42 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PNMA2Q9UL42 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PNMA2Q9UL42 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PNMA2Q9UL42 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PNMA2Q9UL42 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PNMA2Q9UL42 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PNMA2Q9UL42 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PNMA2Q9UL42 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PNMA2Q9UL42 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PNMA2Q9UL42 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PNMA2Q9UL42 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PNMA2Q9UL42 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PNMA2Q9UL42 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PNMA2Q9UL42 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PNMA2Q9UL42 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PNMA2Q9UL42 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PNMA2Q9UL42 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PNMA2Q9UL42 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PNMA2Q9UL42 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PNMA2Q9UL42 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PNMA2Q9UL42 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PNMA2Q9UL42 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PNMA2Q9UL42 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PNMA2Q9UL42 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PNMA2Q9UL42 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PNMA2Q9UL42 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PNMA2Q9UL42 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PNMA2Q9UL42 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PNMA2Q9UL42 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PNMA2Q9UL42 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PNMA2Q9UL42 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PNMA2Q9UL42 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PNMA2Q9UL42 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PNMA2Q9UL42 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PNMA2Q9UL42 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PNMA2Q9UL42 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PNMA2Q9UL42 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PNMA2Q9UL42 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PNMA2Q9UL42 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PNMA2Q9UL42 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PNMA2Q9UL42 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PNMA2Q9UL42 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PNMA2Q9UL42 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PNMA2Q9UL42 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PNMA2Q9UL42 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PNMA2Q9UL42 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PNMA2Q9UL42 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PNMA2Q9UL42 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PNMA2Q9UL42 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PNMA2Q9UL42 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PNMA2Q9UL42 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PNMA2Q9UL42 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PNMA2Q9UL42 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PNMA2Q9UL42 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
PNMA2Q9UL42 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PNMA2Q9UL42 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PNMA2Q9UL42 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PNMA2Q9UL42 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PNMA2Q9UL42 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PNMA2Q9UL42 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PNMA2Q9UL42 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PNMA2Q9UL42 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PNMA2Q9UL42 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PNMA2Q9UL42 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PNMA2Q9UL42 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PNMA2Q9UL42 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PNMA2Q9UL42 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PNMA2Q9UL42 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PNMA2Q9UL42 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PNMA2Q9UL42 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PNMA2Q9UL42 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PNMA2Q9UL42 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PNMA2Q9UL42 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PNMA2Q9UL42 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PNMA2Q9UL42 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PNMA2Q9UL42 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PNMA2Q9UL42 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PNMA2Q9UL42 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms