Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKN5

PRDM4, PR domain zinc finger protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 801 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM4Q9UKN5 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRDM4Q9UKN5 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRDM4Q9UKN5 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRDM4Q9UKN5 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRDM4Q9UKN5 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRDM4Q9UKN5 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRDM4Q9UKN5 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRDM4Q9UKN5 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRDM4Q9UKN5 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRDM4Q9UKN5 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRDM4Q9UKN5 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRDM4Q9UKN5 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRDM4Q9UKN5 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRDM4Q9UKN5 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRDM4Q9UKN5 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRDM4Q9UKN5 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRDM4Q9UKN5 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRDM4Q9UKN5 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRDM4Q9UKN5 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRDM4Q9UKN5 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PRDM4Q9UKN5 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PRDM4Q9UKN5 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PRDM4Q9UKN5 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PRDM4Q9UKN5 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PRDM4Q9UKN5 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PRDM4Q9UKN5 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRDM4Q9UKN5 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRDM4Q9UKN5 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRDM4Q9UKN5 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRDM4Q9UKN5 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRDM4Q9UKN5 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRDM4Q9UKN5 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRDM4Q9UKN5 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRDM4Q9UKN5 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PRDM4Q9UKN5 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRDM4Q9UKN5 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRDM4Q9UKN5 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRDM4Q9UKN5 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRDM4Q9UKN5 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRDM4Q9UKN5 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PRDM4Q9UKN5 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRDM4Q9UKN5 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRDM4Q9UKN5 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRDM4Q9UKN5 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRDM4Q9UKN5 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRDM4Q9UKN5 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRDM4Q9UKN5 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRDM4Q9UKN5 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRDM4Q9UKN5 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRDM4Q9UKN5 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRDM4Q9UKN5 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRDM4Q9UKN5 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRDM4Q9UKN5 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRDM4Q9UKN5 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRDM4Q9UKN5 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRDM4Q9UKN5 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRDM4Q9UKN5 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRDM4Q9UKN5 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRDM4Q9UKN5 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRDM4Q9UKN5 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRDM4Q9UKN5 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRDM4Q9UKN5 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRDM4Q9UKN5 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRDM4Q9UKN5 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRDM4Q9UKN5 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRDM4Q9UKN5 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRDM4Q9UKN5 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRDM4Q9UKN5 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRDM4Q9UKN5 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRDM4Q9UKN5 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRDM4Q9UKN5 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRDM4Q9UKN5 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRDM4Q9UKN5 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRDM4Q9UKN5 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRDM4Q9UKN5 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRDM4Q9UKN5 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRDM4Q9UKN5 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRDM4Q9UKN5 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRDM4Q9UKN5 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRDM4Q9UKN5 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRDM4Q9UKN5 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRDM4Q9UKN5 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRDM4Q9UKN5 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRDM4Q9UKN5 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRDM4Q9UKN5 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRDM4Q9UKN5 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRDM4Q9UKN5 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRDM4Q9UKN5 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRDM4Q9UKN5 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRDM4Q9UKN5 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRDM4Q9UKN5 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRDM4Q9UKN5 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRDM4Q9UKN5 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRDM4Q9UKN5 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PRDM4Q9UKN5 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRDM4Q9UKN5 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRDM4Q9UKN5 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRDM4Q9UKN5 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRDM4Q9UKN5 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRDM4Q9UKN5 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms