Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBE0

SAE1, SUMO-activating enzyme subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAE1Q9UBE0 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SAE1Q9UBE0 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SAE1Q9UBE0 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SAE1Q9UBE0 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SAE1Q9UBE0 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SAE1Q9UBE0 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SAE1Q9UBE0 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SAE1Q9UBE0 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SAE1Q9UBE0 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SAE1Q9UBE0 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SAE1Q9UBE0 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SAE1Q9UBE0 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SAE1Q9UBE0 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SAE1Q9UBE0 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SAE1Q9UBE0 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SAE1Q9UBE0 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SAE1Q9UBE0 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SAE1Q9UBE0 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SAE1Q9UBE0 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SAE1Q9UBE0 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SAE1Q9UBE0 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SAE1Q9UBE0 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SAE1Q9UBE0 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SAE1Q9UBE0 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SAE1Q9UBE0 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SAE1Q9UBE0 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SAE1Q9UBE0 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SAE1Q9UBE0 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SAE1Q9UBE0 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SAE1Q9UBE0 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SAE1Q9UBE0 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SAE1Q9UBE0 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SAE1Q9UBE0 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SAE1Q9UBE0 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SAE1Q9UBE0 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SAE1Q9UBE0 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SAE1Q9UBE0 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SAE1Q9UBE0 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SAE1Q9UBE0 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SAE1Q9UBE0 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SAE1Q9UBE0 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SAE1Q9UBE0 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SAE1Q9UBE0 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SAE1Q9UBE0 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SAE1Q9UBE0 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SAE1Q9UBE0 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SAE1Q9UBE0 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SAE1Q9UBE0 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SAE1Q9UBE0 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SAE1Q9UBE0 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SAE1Q9UBE0 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SAE1Q9UBE0 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SAE1Q9UBE0 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SAE1Q9UBE0 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SAE1Q9UBE0 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SAE1Q9UBE0 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SAE1Q9UBE0 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SAE1Q9UBE0 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SAE1Q9UBE0 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SAE1Q9UBE0 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SAE1Q9UBE0 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SAE1Q9UBE0 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SAE1Q9UBE0 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SAE1Q9UBE0 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SAE1Q9UBE0 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SAE1Q9UBE0 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SAE1Q9UBE0 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SAE1Q9UBE0 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SAE1Q9UBE0 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SAE1Q9UBE0 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SAE1Q9UBE0 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SAE1Q9UBE0 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SAE1Q9UBE0 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SAE1Q9UBE0 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SAE1Q9UBE0 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SAE1Q9UBE0 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SAE1Q9UBE0 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SAE1Q9UBE0 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SAE1Q9UBE0 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SAE1Q9UBE0 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SAE1Q9UBE0 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SAE1Q9UBE0 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SAE1Q9UBE0 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SAE1Q9UBE0 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SAE1Q9UBE0 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SAE1Q9UBE0 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SAE1Q9UBE0 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SAE1Q9UBE0 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SAE1Q9UBE0 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SAE1Q9UBE0 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SAE1Q9UBE0 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SAE1Q9UBE0 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SAE1Q9UBE0 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SAE1Q9UBE0 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SAE1Q9UBE0 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SAE1Q9UBE0 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SAE1Q9UBE0 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SAE1Q9UBE0 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SAE1Q9UBE0 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SAE1Q9UBE0 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms