Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYL9

TMOD3, Tropomodulin-3, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3Q9NYL9 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TMOD3Q9NYL9 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TMOD3Q9NYL9 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TMOD3Q9NYL9 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TMOD3Q9NYL9 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TMOD3Q9NYL9 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TMOD3Q9NYL9 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TMOD3Q9NYL9 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TMOD3Q9NYL9 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TMOD3Q9NYL9 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TMOD3Q9NYL9 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TMOD3Q9NYL9 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TMOD3Q9NYL9 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TMOD3Q9NYL9 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TMOD3Q9NYL9 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TMOD3Q9NYL9 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TMOD3Q9NYL9 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TMOD3Q9NYL9 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TMOD3Q9NYL9 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TMOD3Q9NYL9 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TMOD3Q9NYL9 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TMOD3Q9NYL9 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TMOD3Q9NYL9 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TMOD3Q9NYL9 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TMOD3Q9NYL9 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TMOD3Q9NYL9 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TMOD3Q9NYL9 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TMOD3Q9NYL9 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TMOD3Q9NYL9 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TMOD3Q9NYL9 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TMOD3Q9NYL9 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
TMOD3Q9NYL9 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
TMOD3Q9NYL9 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TMOD3Q9NYL9 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
TMOD3Q9NYL9 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TMOD3Q9NYL9 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TMOD3Q9NYL9 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TMOD3Q9NYL9 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TMOD3Q9NYL9 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TMOD3Q9NYL9 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TMOD3Q9NYL9 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TMOD3Q9NYL9 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TMOD3Q9NYL9 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TMOD3Q9NYL9 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TMOD3Q9NYL9 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
TMOD3Q9NYL9 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
TMOD3Q9NYL9 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TMOD3Q9NYL9 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TMOD3Q9NYL9 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TMOD3Q9NYL9 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TMOD3Q9NYL9 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TMOD3Q9NYL9 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TMOD3Q9NYL9 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TMOD3Q9NYL9 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TMOD3Q9NYL9 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TMOD3Q9NYL9 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TMOD3Q9NYL9 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TMOD3Q9NYL9 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TMOD3Q9NYL9 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TMOD3Q9NYL9 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TMOD3Q9NYL9 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TMOD3Q9NYL9 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TMOD3Q9NYL9 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
TMOD3Q9NYL9 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TMOD3Q9NYL9 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TMOD3Q9NYL9 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TMOD3Q9NYL9 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TMOD3Q9NYL9 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TMOD3Q9NYL9 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TMOD3Q9NYL9 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TMOD3Q9NYL9 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TMOD3Q9NYL9 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TMOD3Q9NYL9 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TMOD3Q9NYL9 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TMOD3Q9NYL9 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TMOD3Q9NYL9 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TMOD3Q9NYL9 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TMOD3Q9NYL9 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TMOD3Q9NYL9 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TMOD3Q9NYL9 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TMOD3Q9NYL9 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TMOD3Q9NYL9 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TMOD3Q9NYL9 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
TMOD3Q9NYL9 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
TMOD3Q9NYL9 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TMOD3Q9NYL9 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TMOD3Q9NYL9 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TMOD3Q9NYL9 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TMOD3Q9NYL9 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TMOD3Q9NYL9 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TMOD3Q9NYL9 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TMOD3Q9NYL9 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TMOD3Q9NYL9 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
TMOD3Q9NYL9 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
TMOD3Q9NYL9 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TMOD3Q9NYL9 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TMOD3Q9NYL9 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TMOD3Q9NYL9 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TMOD3Q9NYL9 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TMOD3Q9NYL9 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms