Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYI0

PSD3, PH and SEC7 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSD3Q9NYI0 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
PSD3Q9NYI0 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.11
PSD3Q9NYI0 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PSD3Q9NYI0 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PSD3Q9NYI0 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
PSD3Q9NYI0 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSD3Q9NYI0 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSD3Q9NYI0 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSD3Q9NYI0 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSD3Q9NYI0 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSD3Q9NYI0 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSD3Q9NYI0 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSD3Q9NYI0 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PSD3Q9NYI0 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSD3Q9NYI0 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSD3Q9NYI0 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSD3Q9NYI0 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSD3Q9NYI0 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSD3Q9NYI0 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSD3Q9NYI0 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PSD3Q9NYI0 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PSD3Q9NYI0 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PSD3Q9NYI0 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PSD3Q9NYI0 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PSD3Q9NYI0 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PSD3Q9NYI0 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PSD3Q9NYI0 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PSD3Q9NYI0 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PSD3Q9NYI0 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
PSD3Q9NYI0 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PSD3Q9NYI0 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PSD3Q9NYI0 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PSD3Q9NYI0 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
PSD3Q9NYI0 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PSD3Q9NYI0 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PSD3Q9NYI0 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSD3Q9NYI0 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSD3Q9NYI0 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSD3Q9NYI0 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSD3Q9NYI0 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSD3Q9NYI0 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSD3Q9NYI0 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSD3Q9NYI0 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSD3Q9NYI0 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSD3Q9NYI0 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSD3Q9NYI0 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSD3Q9NYI0 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSD3Q9NYI0 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSD3Q9NYI0 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSD3Q9NYI0 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSD3Q9NYI0 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSD3Q9NYI0 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSD3Q9NYI0 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSD3Q9NYI0 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PSD3Q9NYI0 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PSD3Q9NYI0 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PSD3Q9NYI0 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PSD3Q9NYI0 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PSD3Q9NYI0 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PSD3Q9NYI0 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PSD3Q9NYI0 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PSD3Q9NYI0 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PSD3Q9NYI0 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PSD3Q9NYI0 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PSD3Q9NYI0 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PSD3Q9NYI0 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PSD3Q9NYI0 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PSD3Q9NYI0 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PSD3Q9NYI0 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PSD3Q9NYI0 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PSD3Q9NYI0 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PSD3Q9NYI0 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PSD3Q9NYI0 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PSD3Q9NYI0 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PSD3Q9NYI0 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PSD3Q9NYI0 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PSD3Q9NYI0 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PSD3Q9NYI0 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PSD3Q9NYI0 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PSD3Q9NYI0 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PSD3Q9NYI0 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PSD3Q9NYI0 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PSD3Q9NYI0 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PSD3Q9NYI0 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PSD3Q9NYI0 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PSD3Q9NYI0 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PSD3Q9NYI0 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PSD3Q9NYI0 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PSD3Q9NYI0 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PSD3Q9NYI0 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PSD3Q9NYI0 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PSD3Q9NYI0 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PSD3Q9NYI0 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PSD3Q9NYI0 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PSD3Q9NYI0 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PSD3Q9NYI0 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PSD3Q9NYI0 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PSD3Q9NYI0 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PSD3Q9NYI0 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PSD3Q9NYI0 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms