Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT62

ATG3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG3Q9NT62 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ATG3Q9NT62 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ATG3Q9NT62 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ATG3Q9NT62 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ATG3Q9NT62 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ATG3Q9NT62 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ATG3Q9NT62 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
ATG3Q9NT62 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
ATG3Q9NT62 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ATG3Q9NT62 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ATG3Q9NT62 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ATG3Q9NT62 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ATG3Q9NT62 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ATG3Q9NT62 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ATG3Q9NT62 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
ATG3Q9NT62 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ATG3Q9NT62 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ATG3Q9NT62 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ATG3Q9NT62 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ATG3Q9NT62 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
ATG3Q9NT62 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ATG3Q9NT62 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ATG3Q9NT62 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ATG3Q9NT62 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ATG3Q9NT62 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
ATG3Q9NT62 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ATG3Q9NT62 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ATG3Q9NT62 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ATG3Q9NT62 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ATG3Q9NT62 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ATG3Q9NT62 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ATG3Q9NT62 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ATG3Q9NT62 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ATG3Q9NT62 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ATG3Q9NT62 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ATG3Q9NT62 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ATG3Q9NT62 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ATG3Q9NT62 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ATG3Q9NT62 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ATG3Q9NT62 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
ATG3Q9NT62 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ATG3Q9NT62 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ATG3Q9NT62 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ATG3Q9NT62 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ATG3Q9NT62 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ATG3Q9NT62 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ATG3Q9NT62 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ATG3Q9NT62 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ATG3Q9NT62 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ATG3Q9NT62 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ATG3Q9NT62 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ATG3Q9NT62 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
ATG3Q9NT62 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ATG3Q9NT62 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
ATG3Q9NT62 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
ATG3Q9NT62 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ATG3Q9NT62 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ATG3Q9NT62 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ATG3Q9NT62 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ATG3Q9NT62 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
ATG3Q9NT62 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
ATG3Q9NT62 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ATG3Q9NT62 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ATG3Q9NT62 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ATG3Q9NT62 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ATG3Q9NT62 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ATG3Q9NT62 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ATG3Q9NT62 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ATG3Q9NT62 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ATG3Q9NT62 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ATG3Q9NT62 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ATG3Q9NT62 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
ATG3Q9NT62 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ATG3Q9NT62 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ATG3Q9NT62 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ATG3Q9NT62 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ATG3Q9NT62 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ATG3Q9NT62 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ATG3Q9NT62 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ATG3Q9NT62 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ATG3Q9NT62 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ATG3Q9NT62 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ATG3Q9NT62 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ATG3Q9NT62 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
ATG3Q9NT62 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ATG3Q9NT62 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ATG3Q9NT62 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ATG3Q9NT62 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ATG3Q9NT62 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ATG3Q9NT62 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ATG3Q9NT62 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ATG3Q9NT62 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ATG3Q9NT62 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ATG3Q9NT62 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ATG3Q9NT62 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
ATG3Q9NT62 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ATG3Q9NT62 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
ATG3Q9NT62 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ATG3Q9NT62 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ATG3Q9NT62 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms