Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRD9

DUOX1, Dual oxidase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUOX1Q9NRD9 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
DUOX1Q9NRD9 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
DUOX1Q9NRD9 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
DUOX1Q9NRD9 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
DUOX1Q9NRD9 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
DUOX1Q9NRD9 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
DUOX1Q9NRD9 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
DUOX1Q9NRD9 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
DUOX1Q9NRD9 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
DUOX1Q9NRD9 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
DUOX1Q9NRD9 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
DUOX1Q9NRD9 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
DUOX1Q9NRD9 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
DUOX1Q9NRD9 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
DUOX1Q9NRD9 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
DUOX1Q9NRD9 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
DUOX1Q9NRD9 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
DUOX1Q9NRD9 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
DUOX1Q9NRD9 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
DUOX1Q9NRD9 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
DUOX1Q9NRD9 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC26.26■■□□□ 1.79
DUOX1Q9NRD9 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
DUOX1Q9NRD9 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
DUOX1Q9NRD9 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
DUOX1Q9NRD9 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
DUOX1Q9NRD9 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
DUOX1Q9NRD9 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
DUOX1Q9NRD9 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
DUOX1Q9NRD9 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
DUOX1Q9NRD9 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
DUOX1Q9NRD9 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
DUOX1Q9NRD9 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
DUOX1Q9NRD9 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
DUOX1Q9NRD9 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
DUOX1Q9NRD9 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
DUOX1Q9NRD9 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC26.24■■□□□ 1.79
DUOX1Q9NRD9 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
DUOX1Q9NRD9 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
DUOX1Q9NRD9 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
DUOX1Q9NRD9 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
DUOX1Q9NRD9 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
DUOX1Q9NRD9 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
DUOX1Q9NRD9 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
DUOX1Q9NRD9 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
DUOX1Q9NRD9 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
DUOX1Q9NRD9 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
DUOX1Q9NRD9 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
DUOX1Q9NRD9 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
DUOX1Q9NRD9 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
DUOX1Q9NRD9 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
DUOX1Q9NRD9 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
DUOX1Q9NRD9 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
DUOX1Q9NRD9 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
DUOX1Q9NRD9 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
DUOX1Q9NRD9 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
DUOX1Q9NRD9 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
DUOX1Q9NRD9 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
DUOX1Q9NRD9 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
DUOX1Q9NRD9 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
DUOX1Q9NRD9 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
DUOX1Q9NRD9 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
DUOX1Q9NRD9 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
DUOX1Q9NRD9 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
DUOX1Q9NRD9 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
DUOX1Q9NRD9 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
DUOX1Q9NRD9 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
DUOX1Q9NRD9 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
DUOX1Q9NRD9 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
DUOX1Q9NRD9 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
DUOX1Q9NRD9 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
DUOX1Q9NRD9 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
DUOX1Q9NRD9 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
DUOX1Q9NRD9 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
DUOX1Q9NRD9 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
DUOX1Q9NRD9 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
DUOX1Q9NRD9 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
DUOX1Q9NRD9 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
DUOX1Q9NRD9 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
DUOX1Q9NRD9 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
DUOX1Q9NRD9 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
DUOX1Q9NRD9 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
DUOX1Q9NRD9 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
DUOX1Q9NRD9 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
DUOX1Q9NRD9 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
DUOX1Q9NRD9 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
DUOX1Q9NRD9 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
DUOX1Q9NRD9 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
DUOX1Q9NRD9 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
DUOX1Q9NRD9 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
DUOX1Q9NRD9 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
DUOX1Q9NRD9 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
DUOX1Q9NRD9 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
DUOX1Q9NRD9 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
DUOX1Q9NRD9 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
DUOX1Q9NRD9 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
DUOX1Q9NRD9 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
DUOX1Q9NRD9 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
DUOX1Q9NRD9 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
DUOX1Q9NRD9 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
DUOX1Q9NRD9 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms