Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC77

CENPJ, Centromere protein J, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,338 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPJQ9HC77 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CENPJQ9HC77 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CENPJQ9HC77 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
CENPJQ9HC77 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
CENPJQ9HC77 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
CENPJQ9HC77 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
CENPJQ9HC77 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
CENPJQ9HC77 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.38
CENPJQ9HC77 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
CENPJQ9HC77 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.38
CENPJQ9HC77 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.38
CENPJQ9HC77 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.38
CENPJQ9HC77 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.38
CENPJQ9HC77 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.38
CENPJQ9HC77 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CENPJQ9HC77 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
CENPJQ9HC77 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CENPJQ9HC77 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CENPJQ9HC77 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
CENPJQ9HC77 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
CENPJQ9HC77 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
CENPJQ9HC77 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
CENPJQ9HC77 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
CENPJQ9HC77 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CENPJQ9HC77 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
CENPJQ9HC77 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CENPJQ9HC77 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CENPJQ9HC77 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CENPJQ9HC77 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CENPJQ9HC77 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
CENPJQ9HC77 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CENPJQ9HC77 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CENPJQ9HC77 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CENPJQ9HC77 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CENPJQ9HC77 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CENPJQ9HC77 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CENPJQ9HC77 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
CENPJQ9HC77 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.93■■■□□ 2.38
CENPJQ9HC77 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
CENPJQ9HC77 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CENPJQ9HC77 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CENPJQ9HC77 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
CENPJQ9HC77 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CENPJQ9HC77 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CENPJQ9HC77 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
CENPJQ9HC77 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
CENPJQ9HC77 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
CENPJQ9HC77 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CENPJQ9HC77 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CENPJQ9HC77 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CENPJQ9HC77 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CENPJQ9HC77 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CENPJQ9HC77 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CENPJQ9HC77 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CENPJQ9HC77 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CENPJQ9HC77 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CENPJQ9HC77 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CENPJQ9HC77 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CENPJQ9HC77 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CENPJQ9HC77 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CENPJQ9HC77 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
CENPJQ9HC77 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
CENPJQ9HC77 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CENPJQ9HC77 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CENPJQ9HC77 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CENPJQ9HC77 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CENPJQ9HC77 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CENPJQ9HC77 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CENPJQ9HC77 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CENPJQ9HC77 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
CENPJQ9HC77 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CENPJQ9HC77 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CENPJQ9HC77 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
CENPJQ9HC77 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
CENPJQ9HC77 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
CENPJQ9HC77 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
CENPJQ9HC77 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
CENPJQ9HC77 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
CENPJQ9HC77 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
CENPJQ9HC77 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
CENPJQ9HC77 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.37
CENPJQ9HC77 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CENPJQ9HC77 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CENPJQ9HC77 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CENPJQ9HC77 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CENPJQ9HC77 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CENPJQ9HC77 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CENPJQ9HC77 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
CENPJQ9HC77 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CENPJQ9HC77 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CENPJQ9HC77 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CENPJQ9HC77 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CENPJQ9HC77 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CENPJQ9HC77 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CENPJQ9HC77 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CENPJQ9HC77 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CENPJQ9HC77 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CENPJQ9HC77 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CENPJQ9HC77 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
CENPJQ9HC77 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms